通过Rcpp模块将用户定义的列表类从C ++暴露给R

时间:2017-05-31 13:07:21

标签: rcpp

我在C ++中编写了一个类classA,并使用Rcpp模块框架将它暴露给R.像魅力一样。

#include "Rcpp.h"
using namespace Rcpp;

class class_A {
  public:
    class_A(double num){this->num = num;};
    double get_num(){return this->num;};
  private:
    double num;
};

RCPP_MODULE(class_A_module) {
  class_<class_A>("class_A")
  .constructor<double>()
  .property("num", &class_A::get_num)
  ;
}

RCPP_EXPOSED_CLASS(class_A);

现在我想有一个类class_B,它可以存储class_A的多个实例(以及其他一些属性)。我的想法是为此目的使用std :: vector:

class class_B {
  public:
    class_B(std::vector<class_A> num_list){this->num_list = num_list;};
    std::vector<class_A> get_num_list(){return this->num_list;};
  private:
    std::vector<class_A> num_list;
};

RCPP_MODULE(class_B_module) {
  class_<class_B>("class_B")
  .constructor<std::vector<class_A>>()
  .property("num_list", &class_B::get_num_list)
  ;
}

RCPP_EXPOSED_CLASS(class_B);

那不编译:

no matching function for call to 'export_range__dispatch(SEXPREC*&,
__gnu_cxx::__normal_iterator<class_A*, std::vector<class_A>
>&, Rcpp::traits::r_type_traits<class_A>::r_category)'

这并不奇怪:Rcpp应该如何将std :: vector暴露给R?

来自this高度相关的rcpp-devel邮件列表线程我明白不管怎么可能创建这个简单的存储类class_B。我想我必须写下own wrap and as implementation

1。到目前为止这是否正确?

2。如果我的简单代码示例,我该如何做到这一点?我发现的所有示例都比我期望的必要的最小实现要复杂得多。

修改 我修改了我的示例代码并尝试查明问题。

标题和实现现已分开:

ex.h

class class_A {
  public:
    class_A(double num);
    double get_num();
  private:
    double num;
};

class class_B {
  public:
    class_B(std::vector<class_A> num_list);
    std::vector<class_A> get_num_list();
  private:
    std::vector<class_A> num_list;
};

ex.cpp

#include "Rcpp.h"
#include "ex.h"

using namespace Rcpp;


class_A::class_A(double num){this->num = num;}
double class_A::get_num(){return this->num;}

RCPP_MODULE(class_A_module) {
  class_<class_A>("class_A")
  .constructor<double>()
  .property("num", &class_A::get_num)
  ;
}

RCPP_EXPOSED_CLASS(class_A);


class_B::class_B(std::vector<class_A> num_list){this->num_list = num_list;}
std::vector<class_A> class_B::get_num_list(){return this->num_list;}

RCPP_MODULE(class_B_module) {
  class_<class_B>("class_B")
  .constructor<std::vector<class_A>>()
  .property("num_list", &class_B::get_num_list)
  ;
}

RCPP_EXPOSED_CLASS(class_B);

这是我尝试实现'wrap'和'as'。

fix.cpp

#include <RcppCommon.h>
#include "ex.h"

// non-intrusive extension via template specialisation
namespace Rcpp {

  template <> class_A as(SEXP aa);
  template <> SEXP wrap(const class_A &a);

  template <> class_B as(SEXP bb);
  template <> SEXP wrap(const class_B &b);

}

#include <Rcpp.h>

// define template specialisations for as and wrap
namespace Rcpp {
  template <> class_A as(SEXP aasexp) {
    double aa = as<double>(aasexp);
    return class_A(aa);
  }

  template <> SEXP wrap(const class_A &a) {
    return Rcpp::wrap(a);
  }

  template <> class_B as(SEXP bbsexp) {
    // ?
  }

  template <> SEXP wrap(const class_B &b) {
    // ?
  }
}

我想有趣的部分是那些我无法理解的部分?

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

一种方法是让一个构造函数使用Rcpp::List,或者如果你不想弄乱class_B的语义,那就是工厂:

class_B* class_B_ctor( List data){
  std::vector<class_A> v ;
  for( int i=0; i<data.size(); i++){
    v.push_back( as<class_A>(data[i]) );
  }
  return new class_B(v) ;
}

您可以使用模块中的.factory方法:

RCPP_MODULE(class_A_module) {
  class_<class_A>("class_A")
    .constructor<double>()
    .property("num", &class_A::get_num)
  ;

  class_<class_B>("class_B")
    .factory< List >( &class_B_ctor )
    .property("num_list", &class_B::get_num_list)
  ;

}

这样:

> a1 <- new( class_A )
> a2 <- new( class_B )
> a1
C++ object <0x103008b78> of class 'class_A' <0x10e4bcd20>
> a2
C++ object <0x103008b78> of class 'class_B' <0x10e4bce20>
> new( class_B, list(a1,a2) )
C++ object <0x10e4de420> of class 'class_B' <0x10e4bce20>