Question

我在MPI程序中使用笛卡尔拓扑。现在我想在程序结束时在每个处理器上收集有关变量的信息（让我们称之为'状态'），并在屏幕上打印结果（从根进程）。通常我会做MPI_Gather，但我怎么能用“笛卡尔风格”来做呢？

Answer 1

提出邻居集体的原始论文提供了阻塞和非阻塞邻居alltoall操作的简单示例实现，您可以使用它们作为示例来旋转您自己的邻居聚集，即使您正在运行的MPI实现也没有尚未支持所有3.0功能：

Hoeffler and Traff: "Sparse Collective Operations for MPI"

MPICH最近也增加了支持。你可以看一下他们的实现，但是他们的代码中有很多无关紧要的东西来支持错误处理，线程安全等等。

Answer 2

如果有人仍然感兴趣，我决定采用非阻塞接收，然后是Waitall：

if (rank == 0) {
        for (i=0; i<m*n; i++) {
            MPI_Irecv(&states[i], 10, MPI_CHAR, MPI_ANY_SOURCE, final_tag, MPI_COMM_WORLD, &report_requests[i]); // Receive final states from all processes
        }
    }   
    // Further computation

if (rank == 0) {
        MPI_Waitall(m*n, report_requests, MPI_STATUSES_IGNORE); // Wait for state reports from all processes

// Process

这对我来说很有用：）

MPI笛卡尔拓扑 - MPI_Gather相当于？

2 个答案: