Question

我必须解决一个问题（问题和代码如下），我在执行这个程序时遇到错误。

Traceback (most recent call last):
  File "C:/Python33/exercise1.py", line 9, in <module>
    for n in range[len(string) - k]:
TypeError: unsupported operand type(s) for -: 'int' and 'list'

-

常见字词问题：查找字符串中最常见的字符。

输入：字符串文本和整数k。 [XGMcKJXnoMhmuXcsjswaejVunrrsDhoiWEzXbiKoiYBEpVmhJszFWCFJAHLPzKfKBhWbCABPCTqASGvgquUtnwSeeYkXtLcbzMxvcsUwjmhHfexpEEhjhjzKvYdODZeCgrehxUnYqDwYMBxaFsYAqIFsBSZslMmTNXPovRtRbqFOhMXMUErCnRgjiBIovOWXxlkYInG]

输出：文本中所有最常见的k-mers。

我设计的代码是：

k=open("dataset_3_6.txt").readlines()
import string
string = str()

for k in string:
  k = int(k)

kmer_count = {}
for n in range(len(string) - k):
  c = string[n:n+k]
  kmer_count[c] = kmer_count[c] + 1 if kmer_count.has_key(c) else 1

max = 0
max_kmer = []
for k,v in kmer_count.iteritems():
  if v > max:
    max_kmer = [k]
    max = v
  elif v == max:
    max_kmer += [k]

print("max_kmer")

Answer 1

顶部有很多问题：

import string

为什么要导入此模块？你打算用它吗？

string = str()

这会隐藏string模块，因此您再也不能使用它，并创建一个默认（即空）字符串（使用string = ''更容易）。

for k in string:
    k = int(k)

由于string是一个空字符串，因此循环零次。

即使它不是空的，k = int(k)也不会有任何影响;你只是一遍又一遍地重新绑定循环变量。如果要将字符串string替换为数字列表，其中每个数字是字符串中相应字符的整数值，则需要通过创建空列表并调用来构建列表append，或使用列表推导（例如string = [int(k) for k in string]）。我不知道你是否真的想在这里做什么。

无论如何，如果string不为空，则在循环之后，k将是字符串中最后一个字符的int值。但是既然如此，k仍然是之前调用open("dataset_3_6.txt").readlines()的结果。也就是说，它是一个行列表。所以，在这：

for n in range(len(string) - k):

您尝试从数字0中减去该行列表。（请记住，您将string设置为空字符串，因此其len为0。）

我不知道你的预期是什么。

部分困惑在于您拥有无意义的变量名称，并且您重复使用相同的名称来反复引用不同的内容。第一个k是行列表。然后它是一个循环变量。然后......你显然想要它是另一回事，但我不知道是什么。然后，它是字典中的每个键。

Python 3 k-mers计算错误

1 个答案: