ggplot2：绘制同一图中不同的密度

Question

我还有另外一个关于ggplot2的问题......但是这次我甚至不确定我想要做什么......让我们从一个简单的例子开始吧;这就是我到目前为止所做的：

library(reshape2)
library(ggplot2)

a.df <- data.frame(
  id=c('a','b','c','d','e','f','g','h','i','j','k','l','m','n','o','p','q','r','s','t','u','v','w','x','y'),
  var1=c(25,35,46,19,35,68,78,23,65,78,98,32,65,74,24,56,78,12,34,76,87,12,54,87,34), 
  group1=c(1,2,'NONE','NONE',1,2,2,1,3,4,3,'NONE','NONE',4,4,3,1,1,2,3,4,'NONE','NONE',2,3), 
  group2=c(1,'NONE',1,1,2,2,'NONE',2,'NONE',2,3,4,3,4,1,'NONE',1,3,4,'NONE',4,4,3,'NONE',2)
)

ggplot(data=subset(a.df,group1!='NONE'), aes(x=var1)) + 
  geom_density() +
  facet_grid(. ~ group1)
ggplot(data=subset(a.df,group1=='NONE'), aes(x=var1)) + 
  geom_density()

ggplot(data=subset(a.df,group2!='NONE'), aes(x=var1)) + 
  geom_density() +
  facet_grid(. ~ group2)
ggplot(data=subset(a.df,group2=='NONE'), aes(x=var1)) + 
  geom_density()

所以我想在这里做的是：

1 - 首先，只是将刻面分成2x2而不是4x1（我试过用ncol = 2，但是没有用）

2 - 绘制第2个绘图（子集（a.df，group1 =='NONE'））以及第1个绘图的4个面中的每个面。为第3和第4个做同样的事。

3 - 如果可能的话，最好的是将2个结果图（4个面中的第1个+第2个，4个面中的第3个和第4个）合二为一，但我在这里看到的问题是facets取决于2个分组变量......是否可能？

总而言之，我觉得输入data.frame需要一些改造，但我不知道如何......非常感谢!!

Answer 1

在post here之后，为每个方面添加单一密度曲线非常简单。我想这就是你想要做的，但我可能是错的。请注意，facet_wrap允许您选择列数，而不是facet_grid。

ggplot(data=subset(a.df,group1!='NONE'), aes(x=var1)) + 
    geom_density() +
    facet_wrap( ~ group1, ncol = 2) +
    geom_density(data=subset(a.df,group1=='NONE', var1), aes(var1, color = "NONE")) +
    scale_color_manual(name = "Baseline", values = "blue")

在将数据集融合为长格式后，对两个组执行相同类型的操作似乎相当简单，但它只能与facet_grid一起使用，因此无法控制列数。

require(reshape2)
dat2 = melt(a.df, measure.vars = c("group1", "group2"), variable.name = "group")

ggplot(data=subset(dat2, value != "NONE"), aes(x=var1)) +
    geom_density() + facet_grid(group ~ value) +
    geom_density(data=subset(dat2,value=='NONE', c(var1, group)), aes(var1), color = "blue")

我不得不使用更多的“强力”方法来使用facet_wrap。基本上我必须创建一种虚拟数据集，其中var1类别的NONE值为每组的1-4级重复。请参阅datnone的输出以获得更好的解释。希望其他人有更好的方法来解决这个问题，因为这可能会完成工作，但肯定不是很好。

datnone = cbind(dat2[dat2$value == "NONE", 2:3], 
             value = rep(1:4, each = nrow(dat2[dat2$value == "NONE",])) )

ggplot(data=subset(dat2, value != "NONE"), aes(x=var1)) +
    geom_density() + facet_wrap(group ~ value, ncol = 2) +
    geom_density(data = datnone, aes(var1), color = "blue")

修改以添加两行，两种颜色

的图例

以下是添加图例并控制linetype和color的一种方法。您也可以控制图例的名称和标签，以使其更好。

ggplot(data=subset(a.df,group1!='NONE'), aes(x=var1, color = "GROUP", linetype = "GROUP")) + 
    geom_density() +
    facet_wrap( ~ group1, ncol = 2) +
    geom_density(data=subset(a.df,group1=='NONE', var1), 
               aes(var1, color = "NONE", linetype = "NONE")) +
    scale_linetype_manual(values = c("solid", "dotted") ) +
    scale_color_manual(values = c("black", "red") )

Answer 2

这是一种避免分面的方法，只需将每个单独的地图保存在列表中，然后调用grid.arrange即可获得所需的结果。

拥有相同情节的多个副本并不容易导致facet_grid。此外，facet_grid并非真正设计用于只有一个面变量的2x2图。

### no. levels of factor group1 not equal to 'NONE' = 4
sum(!levels(a.df$group1)=="NONE")
### define list to store results
list1 <- vector("list", 8)
### subset to remove "none"
df1 <- a.df[!a.df$group1=="NONE", ]
for (i in 1:4){
### subset per level
    df2 <- df1[df1$group1==unique(df1$group1)[i], ]
### plot and title
    g1 <- ggplot(df2, aes(x=var1)) + 
        geom_density() +
            ggtitle(unique(df1$group1)[i])
        list1[[2*i-1]] <- g1
}
### plots of NONE
df1 <- a.df[a.df$group1=="NONE", ] 
g2 <- ggplot(df1, aes(x=var1)) +
    geom_density() +
    ggtitle("NONE")
list1[[2]] <- list1[[4]] <- list1[[6]] <- list1[[8]] <- g2
### 
library(gridExtra)
do.call(grid.arrange, c(list1, list(nrow=2, ncol=4)))

给

您应该能够对此进行调整并对其他感兴趣的图表执行相同的操作。