Prody用于建模蛋白质结构python

Question

我们可以使用ProDy来模拟蛋白质的结构吗？有没有其他方法可以使用Python模拟蛋白质的结构？

谢谢

Answer 1

是的，ProDy可以完成这项工作。

如果你喜欢使用“only”Python，那么检查aslo PyMOL（http://www.pymol.org/） 用于可视化蛋白质和分子结构。

如果您想运行模拟，那么我将选择用于分子动力学模拟的GROMACS软件包，但它主要是用C语言编写的。

http://www.gromacs.org/