Question

我尝试在webpage：

中安装topGO包作为cmd

source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("topGO")

但是有一些错误如下：

错误：.onLoad在'GO.db'的loadNamespace（）中失败，详细信息： call：sqliteExecStatement（con，statement，bind.data）错误：RS-DBI驱动程序:(语句错误：磁盘I / O错误）错误：加载失败执行停止错误：加载失败

然后我想在R中安装GO.db包作为网页上的说明

source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("GO.db")

我反击上面发布的同样问题：

警告：找到'sort'的多个方法表警告：找到'rank'的多个方法表警告：找到'as.data.frame'的多个方法表警告：找到'unlist'的多个方法表警告：找到“匹配”的多个方法表错误：.onLoad在'GO.db'的loadNamespace（）中失败，详情： call：sqliteExecStatement（con，statement，bind.data）错误：RS-DBI驱动程序:(语句错误：数据库已锁定）错误：加载失败执行停止错误：加载失败

这是我在R上输入sessionInfo（）之后的输出：

R version 3.0.1（2013-05-16）平台：x86_64-unknown-linux-gnu   （64位）

locale：[1] LC_CTYPE = zh_CN.UTF-8 LC_NUMERIC = C
  [3] LC_TIME = zh_CN.UTF-8 LC_COLLATE = zh_CN.UTF-8 [5]   LC_MONETARY = zh_CN.UTF-8 LC_MESSAGES = zh_CN.UTF-8 [7] LC_PAPER = C   LC_NAME = C [9] LC_ADDRESS = C
  LC_TELEPHONE = C [11] LC_MEASUREMENT = zh_CN.UTF-8   LC_IDENTIFICATION = C

附加基础包：[1]并行统计图形grDevices   utils数据集方法[8]基础

其他附件包：[1] AnnotationDbi_1.22.6 Biobase_2.20.1
  BiocGenerics_0.6.0 [4] BiocInstaller_1.10.3

通过命名空间加载（而不是附加）：[1] DBI_0.2-7
  IRanges_1.18.3 RSQLite_0.11.4 stats4_3.0.1 tools_3.0.1

我认为安装GO.db软件包存在问题。任何建议都很感激！感谢

在R中安装topGO包

0 个答案: