R ggbio plotIdeogram错误

时间:2013-09-20 14:29:57

标签: r bioconductor

我在ggbio Introduction and quick start page.的第20,22页上运行了表意文字示例 这条线

p.ideo <-plotIdeogram(genome="hg19")

给出了这个结果。

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Error: Expectation failed

使用“TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene”包时出现一些初始错误(返回“错误:对象'.setDummyField'未找到”,这是3.0.0和3.0.1之间的兼容性问题),我安装了R 3.0.1并重新安装了我需要的所有软件包。在这里正确加载的R 3.0.0中没有正确加载的ggbio。

我已经完整并减少了第22页上的数字轨迹,但顶部的表意文字是空白的。有没有办法获得那个表意文字?

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