Question

我试图在循环中使用cor.test() r函数，但我无法将它变为'函数'。我可以单独调用这些项目，但我更喜欢使用循环。

我的代码选择如下：

hNames= scan(fileName, nlines = 1, what = character(), sep = ',')
mydata = read.table(fileName, header = TRUE, sep = ',')
names = c(hNames[2:length(hNames)])

for (i in names(mydata[2:length(mydata)]))
{
        for (j in names(mydata[2:length(mydata)]))
        {cor.test(mydata[[i]], mydata[[j]], method='spearman')}
}

哪个不起作用（没有输出），但是，这样做：

cor.test(mydata$Bacteroidetes, mydata$Actinobacteria, method = 'spearman')

我在循环中尝试了几种变体，但是我一直遇到一个错误，说'x'（或'y'）必须是数字向量。

我的数据看起来像这样（print（mydata））

PHYLUM Actino Bacter ...Tenericutes
x1     25       45    ...8
x1     26       42    ...8
x2     40       43    ...7
x2     42       41    ...5
x2     40       41    ...5

或者采用原始格式：

PHYLUM,Actinobacteria,Bacteroidetes,...Tenericutes
x1,25,45,...8
x1,26,42,...8
x2,40,43,...7
x2,42,41,...5
x2,40,41,...5

我做错了什么，怎样才能改变它。代码会产生一些输出吗？

谢天谢地。

Answer 1

用打印方式调用cor.test。

循环调用r cor.test（）没有输出

1 个答案: