Question

我使用MayaVi Python库使用points3d类绘制3d点。 The documentation指定通过第四个参数s：

指定每个点的颜色

此外，您可以传递与x，y相同形状的第四个数组，和z为每个点或函数提供相关的标量值 f（x，y，z）返回标量值。可以使用此标量值调整点的颜色和大小。

指定每个点的标量值，将点映射到颜色图，例如copper，jet或hsv。例如。来自他们的文件：

import numpy
from mayavi.mlab import *

def test_points3d():
    t = numpy.linspace(0, 4*numpy.pi, 20)
    cos = numpy.cos
    sin = numpy.sin

    x = sin(2*t)
    y = cos(t)
    z = cos(2*t)
    s = 2+sin(t)

    return points3d(x, y, z, s, colormap="copper", scale_factor=.25)

给出：

enter image description here

相反，我想将每个点的实际值指定为（r，g，b）元组。这可能在MayaVi中吗？我试过用一组元组替换s，但是会抛出一个错误。

Answer 1

在今天的大部分时间里努力解决这个问题之后，我找到了一个相对简单的方法来完成问题所要求的 - 为每个点指定一个RGB元组。诀窍就是定义一个颜色映射，其条目数与要绘制的点数完全相同，然后将参数设置为索引列表：

# Imports
import numpy as np
from mayavi.mlab import quiver3d, draw

# Primitives
N = 200 # Number of points
ones = np.ones(N)
scalars = np.arange(N) # Key point: set an integer for each point

# Define color table (including alpha), which must be uint8 and [0,255]
colors = (np.random.random((N, 4))*255).astype(np.uint8)
colors[:,-1] = 255 # No transparency

# Define coordinates and points
x, y, z = colors[:,0], colors[:,1], colors[:,2] # Assign x, y, z values to match color
pts = quiver3d(x, y, z, ones, ones, ones, scalars=scalars, mode='sphere') # Create points
pts.glyph.color_mode = 'color_by_scalar' # Color by scalar

# Set look-up table and redraw
pts.module_manager.scalar_lut_manager.lut.table = colors
draw()

Answer 2

您可以使用rgb查找表并使用您想要的任何逻辑将rgb值映射到它。这是一个简单的例子：

import numpy, random
from mayavi.mlab import *

def cMap(x,y,z):
    #whatever logic you want for colors
    return [random.random() for i in x]

def test_points3d():
    t = numpy.linspace(0, 4*numpy.pi, 20)
    cos = numpy.cos
    sin = numpy.sin

    x = sin(2*t)
    y = cos(t)
    z = cos(2*t)
    s = cMap(x,y,z)

    return points3d(x, y, z, s, colormap="spectral", scale_factor=0.25)

test_points3d()

我不知道你想要什么颜色方案，但你可以评估x，y，z的位置，并返回与你正在寻找的rgb值对应的标量。

Answer 3

我找到了一种更好的直接设置颜色的方法。

您可以非常轻松地创建自己的直接LUT。假设我们想要256 ** 3粒度：

#create direct grid as 256**3 x 4 array 
def create_8bit_rgb_lut():
    xl = numpy.mgrid[0:256, 0:256, 0:256]
    lut = numpy.vstack((xl[0].reshape(1, 256**3),
                        xl[1].reshape(1, 256**3),
                        xl[2].reshape(1, 256**3),
                        255 * numpy.ones((1, 256**3)))).T
    return lut.astype('int32')

# indexing function to above grid
def rgb_2_scalar_idx(r, g, b):
    return 256**2 *r + 256 * g + b

#N x 3 colors
colors = numpy.array([_.color for _ in points])

#N scalars
scalars = numpy.zeros((colors.shape[0],))

for (kp_idx, kp_c) in enumerate(colors):
    scalars[kp_idx] = rgb_2_scalar_idx(kp_c[0], kp_c[1], kp_c[2])

rgb_lut = create_8bit_rgb_lut()

points_mlab = mayavi.mlab.points3d(x, y, z
                                   keypoint_scalars,
                                   mode = 'point')

#magic to modify lookup table 
points_mlab.module_manager.scalar_lut_manager.lut._vtk_obj.SetTableRange(0, rgb_lut.shape[0])
points_mlab.module_manager.scalar_lut_manager.lut.number_of_colors = rgb_lut.shape[0]
points_mlab.module_manager.scalar_lut_manager.lut.table = rgb_lut

Answer 4

现在可以使用color参数

完成此操作

from mayavi import mlab
import numpy as np

c = np.random.rand(200, 3)
r = np.random.rand(200) / 10.

mlab.points3d(c[:, 0], c[:, 1], c[:, 2], r, color=(0.2, 0.4, 0.5))

mlab.show()

在MayaVi中指定3D点的绝对颜色

4 个答案: