我正在尝试使用R Studio对一组数据上的地面筑巢小鸡进行不同类型栖息地使用的成分分析。它开始处理但永不停止。我必须手动停止处理或杀死R Studio。 （R中的结果相同）
我正在使用adehabitatHS软件包中的campana函数。从adehabitat我能够毫无问题地运行样本野鸡和松鼠数据。 （我试过从两个包中调用campana得到相同的结果。）
对于每只小鸡，可用的栖息地因其作为巢穴周围的缓冲区而变化。
我的数据 这是每只小鸡的可用栖息地：
grass fallow.plot oil.seed.rape spring.barley winter.wheat maize other.crops other woodland hedgerow
1 23.35 7.53 45.75 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 23.37 0.00
2 86.52 10.35 0.00 0.00 1.24 0.00 0.00 1.89 0.00 0.00
3 5.18 10.33 28.36 38.82 0.00 0.00 17.17 0.14 0.00 0.00
4 4.26 18.32 27.31 32.66 3.82 0.00 0.00 5.02 5.52 3.09
5 4.26 18.32 27.31 32.66 3.82 0.00 0.00 5.02 5.52 3.09
6 12.52 10.35 0.00 0.00 0.00 18.02 43.59 13.15 2.37 0.00
7 21.41 11.56 59.25 0.00 0.00 0.00 0.00 5.82 0.00 1.96
8 21.41 11.56 59.25 0.00 0.00 0.00 0.00 5.82 0.00 1.96
9 36.17 16.93 0.00 30.14 0.00 0.00 0.00 7.08 9.68 0.00
10 0.00 12.17 26.49 0.00 3.99 55.77 0.00 1.58 0.00 0.00
11 0.00 10.27 67.41 1.93 18.30 0.00 0.00 1.18 0.00 0.91
12 2.66 5.38 0.00 14.39 54.06 0.00 8.40 3.83 7.84 3.44
13 2.66 5.38 0.00 14.39 54.06 0.00 8.40 3.83 7.84 3.44
14 84.22 8.00 0.00 0.00 0.00 2.90 0.00 0.22 3.84 0.82
15 84.22 8.00 0.00 0.00 0.00 2.90 0.00 0.22 3.84 0.82
16 86.85 13.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.11 0.00 0.00
17 86.85 13.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.11 0.00 0.00
18 86.85 13.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.11 0.00 0.00
19 86.85 13.04 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.11 0.00 0.00
20 21.41 8.11 0.47 8.08 0.00 0.00 56.78 2.26 0.00 2.89
这是使用过的栖息地（mcp）：
grass fallow.plot oil.seed.rape spring.barley winter.wheat maize other.crops other woodland hedgerow
1 41.14 58.67 0.19 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0 0.0
2 35.45 64.55 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0 0.0
3 10.10 60.04 7.72 21.37 0.00 0.00 0.00 0.77 0 0.0
4 0.00 44.55 0.00 50.27 0.00 0.00 0.00 5.18 0 0.0
5 2.82 48.48 44.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0 3.9
6 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 100.00 0 0.0
7 0.00 87.41 12.59 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0 0.0
8 0.00 83.59 16.41 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0 0.0
9 0.00 100.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0 0.0
10 0.00 18.93 0.00 0.00 0.00 81.07 0.00 0.00 0 0.0
11 0.00 100.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0 0.0
12 0.00 22.79 0.00 0.00 77.13 0.00 0.00 0.08 0 0.0
13 0.00 0.00 0.00 0.00 100.00 0.00 0.00 0.00 0 0.0
14 54.60 44.97 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.43 0 0.0
15 62.86 36.57 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.57 0 0.0
16 11.15 88.10 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.75 0 0.0
17 20.06 79.62 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.32 0 0.0
18 38.64 60.95 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.41 0 0.0
19 3.81 95.81 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.38 0 0.0
20 0.00 3.56 0.00 0.00 0.00 0.00 96.44 0.00 0 0.0
我尝试了相同结果的参数和随机化测试。我正在运行的代码：
habuse <- compana(used, avail, test = "randomisation",rnv = 0.001, nrep = 500, alpha = 0.1)
habuse <- compana(used, avail, test = "parametric")
我出错的任何想法？
答案 0 :(得分：0)
我发现了自己问题的答案。对于使用的数据，该函数用您指定的值替换0值（在我的情况下为0.001）。但它并没有取代可用数据中的0值，也不喜欢它们。
我在可用表中用0.001替换了所有0，调整了其他值并且功能正常工作。