优化八度音/ matlab函数的运行时间

时间:2013-08-16 20:36:36

标签: multithreading matlab octave


我使用的是Google地球工具箱,用于Octave,它与为MATLAB制作的库相同。有关该工具的MATLAB文档,请参阅this link

不幸的是,我对某个功能遇到了一些麻烦:ge_quiver。此函数创建一个箭头图并将结果转换为KML代码。我的问题 是因为我喜欢它有点太慢了。

对于30x30大小的数据变量,该功能大约需要10秒钟才能完成。这很好,除了我正在尝试制作动画箭袋图,其他23个相同大小的数据变量(总共24个)。由于Octave(以及MATLAB)通常只在一个线程上运行,所以整个过程是串行运行的,需要10 * 24 = 240 s。

我尝试了parfor个循环,但它们只从总运行时间中删除了10秒。我有一台16核的电脑。考虑到,这是令人尴尬的平行(变量之间没有依赖关系),理想情况下应该采取:

前16个变量的10秒
8个剩余变量的+ 10秒
-------------------------------------------------- ----
=总共20秒。

我甚至没有测试过arrayfun,因为我不知道如何调整我的函数(p_ge_quiver)。尽管如此,许多人都表示,arrayfun不会让它更快。

以下代码与我正在尝试的内容大致相同。记住变量 data_u的大小为30x30x24。 data_vlonlat也是如此。

...
...

[YYYY,MM,DD,HH,mm,ss] = ncdate(NCFILE);
date_s.year   = YYYY;
date_s.month  = MM;
date_s.day    = DD;
date_s.hour   = HH;
date_s.minute = mm;
date_s.second = ss;

TIMESTEP = 60;
parfor i = 1:size(data_u,3)
    dt     = TIMESTEP*i;
    kml(i) = p_ge_quiver(lon,lat,data_u,data_v,dt,TIMESTEP,data_s);
endparfor

...
...

function kml = p_ge_quiver(lon,lat,u,v,data_time,step,date_s)
% V_GE_QUIVER - Writes the quiver plot into KML.

    % Get date variables.
    YYYY = date_s.year;
    MM   = date_s.month;
    DD   = date_s.day;
    HH   = date_s.hour;
    mm   = date_s.minute;
    ss   = date_s.second;

    % Date format. Use Google's.
    F = 'yyyy-mm-ddTHH:MM:SSZ';

    % Start and end dates of data.
    tStart = datestr(datenum(YYYY,MM,DD,HH,mm+data_time,ss),F);
    tEnd   = datestr(datenum(YYYY,MM,DD,HH,mm+data_time+step,ss),F);

    % Quiver plot.
    kml = ge_quiver(lon,lat,u,v,'timeSpanStart', tStart, ...
                                'timeSpanStop' , tEnd  , ...
                                'visibility'   , 0     , ...
                                'lineColor'    , 'AAFFFFFF');



end

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

我觉得问题出在ge_quiver内部没有显示的内容上。除此之外,您应该注意到这种语言旨在编写矢量化代码(而且不仅仅是因为速度的不同)。

通过使用矢量化语法,查看代码,您可以简化它(这通常也会对速度产生影响):

step = 60;
dt = step:step:(step * size (data_u, 3));

## Get date variables.
YYYY = date_s.year;
MM   = date_s.month;
DD   = date_s.day;
HH   = date_s.hour;
mm   = date_s.minute;
ss   = date_s.second;

## Date format. Use Google's.
F = "yyyy-mm-ddTHH:MM:SSZ";

tStart = datestr (datenum (YYYY, MM, DD, HH, mm + dt       , ss), F);
tEnd   = datestr (datenum (YYYY, MM, DD, HH, mm + dt + step, ss), F);

此时,tStarttEnd包含您需要的所有日期,每行一次。唯一需要的循环如下:

for i=1:rows(tStart)
    kml = ge_quiver (lon, lat, data_u, data_v, "timeSpanStart", tStart(i,:), ...
                                               "timeSpanStop" , tEnd(i,:)  , ...
                                               "visibility"   , 0          , ...
                                               "lineColor"    , "AAFFFFFF");
endfor

此时完全取决于ge_quiver的作用。您链接的mathworks网站显示为维护中。我查看the Google Earth toolbox website并找不到该功能(虽然他们有ge_quiver3功能。)

我认为这种语言的函数应该允许向量输入,所以去确认它。也许你根本不需要循环。