Question

Language engines是一个很棒的knitr功能。我们可以使用knitr中的任何语言，包括但不限于R. 但是如果我想使用在一个chunck中定义的结果/变量，在另一个chunck中使用相同的语言或其他语言（更性感的选项）该怎么办？）？

最好用一些代码来解释我的想法。在这里，我定义了4个块，其中2个在 python 中，2个在 R 中。

首先我在python中定义一个变量x：

## I define engien path explicitly here (TODO: set it globally)
```{r,engine='python',engine.path='C:/Anaconda/python.exe' }
x = 1
print x
```
## 1

现在尝试在新的python chunck中使用x：

```{r,engine='python',engine.path='C:/Anaconda/python.exe' }
x = x +1
print x

```

没有错误，但结果令人惊讶，看起来x在这里是NULL。现在，如果我尝试在新的R chunck中使用x：

```{r fig.width=7, fig.height=6}
x +1
y = 2
```
## Error: object 'x' not found

我收到错误。现在如果我尝试在新的R块中使用y并且它工作正常。 r引擎可以使用前一个R chunck中定义的变量。请注意，这不适用于python。

```{r fig.width=7, fig.height=6}
y+3
```
## [1] 5

为什么R和python之间的行为存在差异？它是结构性的，因为R的范围规则还是仅仅是knitr中尚未实现的未来？或者也许是一个错误？

Answer 1

这是记录在案的行为。

请参阅http://yihui.name/knitr/demo/engines/

除了engine ='R'（默认），所有块都是单独执行的会话，因此无法直接共享变量。如果我们想利用在以前的块中创建的对象，我们通常必须这样做将它们写入文件（作为副作用）。对于bash引擎，我们可以使用 Sys.setenv（）将变量从R导出到bash（示例）

Answer 2

你可以在python的启动（PYTHONSTARTUP）文件中放置一些东西。当退出利用atexit时，精心设计的启动文件可以导出文件中的所有已知变量。

这是一个打印所有新全局变量的配方：

>>> import atexit
>>> def list_globals(known_globals=globals().keys()):
...     new_globals = set(globals().keys())
...     new_globals -= set(known_globals)
...     for key in new_globals:
...        print '%s=%s' % (key, globals()[key])
... 
>>> atexit.register(list_globals)
<function list_globals at 0x107140e60>
>>> del list_globals
>>> del atexit
>>>

以上是运行上述代码后的示例会话。

>>> 
>>> def foo():
...    a  = 1
... 
>>> b = 2
>>> ^D
b=2
foo=<function foo at 0x107140d70>

您可以改为使用文件/套接字/消息队列/等。

在不同语言中定义的knitr中的块之间混合变量/结果？

2 个答案: