我有一个双向重复测量设计(3 x 2),我想弄清楚如何计算效果大小(部分eta平方)。
我有一个包含数据的矩阵(称为a),如此(重复测量)
A.a A.b B.a B.b C.a C.b
1 514.0479 483.4246 541.1342 516.4149 595.5404 588.8000
2 569.0741 550.0809 569.7574 599.1509 621.4725 656.8136
3 738.2037 660.3058 812.2970 735.8543 767.0683 738.7920
4 627.1101 638.1338 641.2478 682.7028 694.3569 761.6241
5 599.3417 637.2846 599.4951 632.5684 626.4102 677.2634
6 655.1394 600.9598 729.3096 669.4189 728.8995 716.4605
idata =
Caps Lower
A a
A b
B a
B b
C a
C b
我知道如何使用汽车套件重复测量ANOVA(3型SS在我的领域是标准的,虽然我知道它会导致逻辑错误..如果有人想向我解释,就像我是5我很乐意理解它):
summary(Anova(lm(a ~ 1),
idata=idata,type=3,
idesign=~Caps*Lower)),
multivariate=FALSE)
我认为我想要做的是将这部分摘要打印出来:
单变量III型重复测量ANOVA假设球形
SS num Df Error SS den Df F Pr(>F)
(Intercept) 14920141 1 153687 5 485.4072 3.577e-06 ***
Caps 33782 2 8770 10 19.2589 0.000372 ***
Lower 195 1 13887 5 0.0703 0.801451
Caps:Lower 2481 2 907 10 13.6740 0.001376 **
并用它来计算部分ETA平方。所以,如果我没有弄错的话,我需要从第一列中取出SS并将其除以(本身+该行的SS错误)每个效果。这是正确的方法吗?如果是这样,我该怎么办?我无法弄清楚如何从摘要打印中引用值。
答案 0 :(得分:7)
可以使用etasq
包中的heplots
函数计算部分eta平方
library(car)
mod <- Anova(lm(a ~ 1),
idata = idata,
type = 3,
idesign = ~Caps*Lower)
mod
library(heplots)
etasq(mod, anova = TRUE)
因为您询问的是计算:
从?etasq
:'对于单变量线性模型,经典η^ 2 = SSH / SST和部分η^ 2 = SSH /(SSH + SSE)。这些在单向设计中是相同的。'。
如果您希望检查具有class
的模型的η^ 2的计算代码,则可以使用getS3method(f = "etasq", class = "Anova.mlm")
。