Question

我正在尝试本地编译使用openmpi（1.6.3）的软件，但是我收到了这个错误：

restraint_camshift2.o :(。toc + 0x98）：未定义引用     `ompi_mpi_cxx_op_intercept'

restraint_camshift2.o：在功能上     `Intracomm'：

/home/users/didymos/openmpi-1.6.3/include/openmpi/ompi/mpi/cxx/intracomm.h:25：     对'MPI :: Comm :: Comm（）'
的未定义引用
/home/users/didymos/openmpi-1.6.3/include/openmpi/ompi/mpi/cxx/intracomm.h:25：     未明确引用MPI::Comm::Comm()' restraint_camshift2.o: In function Intracomm'：

/home/users/didymos/openmpi-1.6.3/include/openmpi/ompi/mpi/cxx/intracomm_inln.h:23：     未明确引用MPI::Comm::Comm()' restraint_camshift2.o: In function Intracomm'：

/home/users/didymos/openmpi-1.6.3/include/openmpi/ompi/mpi/cxx/intracomm.h:25：     对'MPI :: Comm :: Comm（）'
的未定义引用
/home/users/didymos/openmpi-1.6.3/include/openmpi/ompi/mpi/cxx/intracomm.h:25：     对'MPI :: Comm :: Comm（）'
的未定义引用
restraint_camshift2.o：/home/users/didymos/openmpi-1.6.3/include/openmpi/ompi/mpi/cxx/intracomm.h：25：     更多未定义的对“MPI :: Comm :: Comm（）”的引用如下     restraint_camshift2.o :( data.rel.ro._ZTVN3MPI3WinE [_ZTVN3MPI3WinE] + 0x48）：

对“MPI :: Win :: Free（）”的未定义引用     restraint_camshift2.o :( data.rel.ro._ZTVN3MPI8DatatypeE [_ZTVN3MPI8DatatypeE] + 0x78）：

未定义引用`MPI :: Datatype :: Free（）'collect2：error：ld

返回1退出状态make [3]： * [mdrun]错误1 make [3]：离开

目录`/home/users/didymos/src/gromacs-4.5.5/src/kernel'make [2]： * [all-recursive]错误1

make [2]：离开目录`/home/users/didymos/src/gromacs-4.5.5/src'

make [1]： * [all]错误2

make [1]：离开目录`/home/users/didymos/src/gromacs-4.5.5/src'

make： * [all-recursive]错误1

我正在使用gcc 4.7.3 任何想法或建议？谢谢！最好，

托梅克

Answer 1

看起来您没有链接到正确的库。当您为MPI编译代码时（无论是Open MPI，MPICH还是其他任何实现），您需要使用MPI编译器包装器来编译而不是直接编译gcc。

您需要说gcc myprog.c，而不是说mpicc myprog.c。或者，与此应用程序的情况一样，将g++ myprog.c更改为mpic++ myprog.c。

在幕后，MPI将调用GCC（或您告诉它使用的任何其他编译器）来进行实际编译，但它还将添加所有相应的库，编译器标志以及您需要的任何其他内容。

Answer 2

用户在这里发布了同样的问题：

http://www.open-mpi.org/community/lists/users/2013/07/22296.php

邮件列表上发布的解决方案是：使用mpiCC（或mpic ++），而不是mpicc。

编译期间的openmpi错误

2 个答案: