在networkx图中合并2个节点

时间:2013-07-05 07:06:41

标签: python graph graph-theory networkx

我正在通过networkx中的blockmodel函数。这似乎与我想要的非常相似。

我希望在networkx图中合并两个节点,并将其替换为与要连接的任何节点相对应的节点标签。其余节点应保持原样,名称不做任何更改。 (节点连接规则如块模型1教程中所述)

  • 至于我的理解,blockmodel需要在使用之前创建整个图形的显式分区,这不太方便。
  • 无法控制所形成的块模型的名称(即新图的节点)。

如何实现将2个节点合并为一个看似简单的任务?我想在带有加权边的无向图上进行。

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

这是我尝试为我正在处理的图形着色程序创建一个合并函数。但是,它不适用于加权边缘。

import networkx as nx
# G is a graph created using nx
# this is to establish the number of colors
k = 5
# inputs node1 and node2 are labels of nodes, e.g. 'a' or 'b' etc.
def coalesce(G,node1,node2):
    """Performs Briggs coalescing. Takes in the graph and two nodes.
    Returns 1 if unable to coalesce, 0 otherwise."""
    if node1 in G.neighbors(node2) or node2 in G.neighbors(node1):
        print "Cannot coalesce. Node",node1,"and node",node2,"share an edge"
        return 1
    elif G.degree(node1)+G.degree(node2) >= k:
        print "Cannot coalesce. Combined degree of",node1,"and",node2,"\
is",G.degree(node1)+G.degree(node2),"which is too high for k =",k
        return 1
    else:
        newedge = []
        for i in range(len(G.neighbors(node2))):
            newedge.append((node1 , G.neighbors(node2)[i]))
        G.add_edges_from(newedge)
        G.remove_node(node2)
        nx.relabel_nodes(G, {node1:node1+node2},copy=False)
    return 0