Question

我有一个Rpy2数据框为<class 'rpy2.robjects.vectors.DataFrame'>。如何将每行作为元素转换为Python列表或元组？谢谢！

Answer 1

我明白了。如果您正在寻找答案，我希望这会有所帮助：

output = [tuple([df[j][i] for j in range(df.ncol)]) for i in range(df.nrow)]

Answer 2

我最近偶然发现了一个潜在的问题。给定来自R的数据框：

|   |   a   | c | b |  d  |
|---|-------|---|---|-----|
| 1 | info1 | 2 | 1 | op1 |
| 2 | info2 | 3 | 2 | 3   |
| 3 | info3 | 4 | 3 | 3   |
| 4 | info4 | 5 | 4 | 3   |
| 5 | info5 | 6 | 5 | 3   |
| 6 | info6 | 7 | 6 | 3   |
| 7 | 9     | 8 | 7 | 3   |

_{（是的我知道 - 一列中的混合数据类型，即str和float可能不太现实，但对于仅有因素的列，情况也是如此）}

转换将显示列a和d的索引，而不是通常预期的实际值。问题如rpy2手册中所述：

R的因素有点奇怪：它们旨在表示标记的记忆效率矢量，并且为了实现它，将其实现为整数向量，其与标签的（可能更短的）矢量相关联。每个整数表示标签在相关标签矢量中的位置。

以下粗略草案代码是处理此案例的一步：

colnames = list(dataframe.colnames)
rownames=list(dataframe.rownames)
col2data = []
for cn,col in dataframe.items():
    if isinstance(col,robjects.vectors.FactorVector) is True:
        colevel = tuple(col.levels)
        col = tuple(col)
        ncol = []
        for i in col:
            k=i-1
            ncol.append(colevel[k])
    else:
        ncol = tuple(col)
    col2data.append((cn,ncol))

col2data.append(('rownames',rownames))
col2data = dict(col2data)

输出是一个带有列名到值映射的dict。使用循环并转置列表列表将根据需要生成输出。

如何将Rpy2数据帧转换为python列表或元组？

2 个答案: