交互式地使用xy点图集群 - r中的组操作

Question

我有大量的X和Y变量以及它们的集群成员资格列。集群成员资格（组）可能并不总是正确的（完善集群算法的限制），我想以交互方式可视化集群并将集群成员资格操纵到已识别的点。

我尝试了rggobi，以下是我能够达到的目的（我不是说我需要使用rggobi / ggobi，如果有更好的选择，欢迎提出建议）。

# data
set.seed (1234)
c1 <- rnorm (40, 0.1, 0.02); c2 <- rnorm (40, 0.3, 0.01)
c3 <- rnorm (40, 0.5, 0.01); c4 <- rnorm (40, 0.7, 0.01)
c5 <- rnorm (40, 0.9, 0.03)
Yv <- 0.3 + rnorm (200, 0.05, 0.05)
myd <- data.frame (Xv = round (c(c1, c2, c3, c4, c5), 2), Yv = round (Yv, 2),
 cltr = factor (rep(1:5, each = 40)))

require(rggobi)
g <- ggobi(myd)
display(g[1], vars=list(X="Xv", Y="Yv"))

您可以看到五个群集，颜色与 cltr 变量不同。我手动识别出异常值的点，我想在cltr变量中将它们的值设为NA。是他们解除此类成员资格和写入文件的任何简单方法。

Answer 1

您可以尝试identify手动获取积分的索引：

## use base::plot
plot(myd$Xv, myd$Yv, col=myd$cltr)

exclude <- identify(myd$Xv, myd$Yv) ## left click on the points you want to exclude (right click to stop/finish)

myd$cltr[exclude] <- NA