Question

我们可以使用sparseMatrix或spMatrix从索引和非零元素的值构造稀疏矩阵。有没有函数将稀疏矩阵转换回索引和所有非零元素的值？例如

i <- c(1,3,5); j <- c(1,3,4); x <- 1:3
A <- sparseMatrix(i, j, x = x)

B <- sparseToVector(A)
## test case:
identical(B,cbind(i,j,x))

是否有任何功能与sparseToVector做类似的工作？

Answer 1

您的矩阵A采用稀疏压缩格式（类dgCMatrix）。您可以通过

将其强制转换为非压缩稀疏格式

A.nc <- as (A, "dgTMatrix")

或者，您可以在giveCsparse = TRUE来电中指定sparseMatrix。

dgTMatrix的三元组形式基本上包含您在广告资源i，j和x中寻找的所有内容，只有i和使用基于0的偏移完成j索引：

> str (A.nc)
Formal class 'dgTMatrix' [package "Matrix"] with 6 slots
  ..@ i       : int [1:3] 0 2 4
  ..@ j       : int [1:3] 0 2 3
  ..@ Dim     : int [1:2] 5 4
  ..@ Dimnames:List of 2
  .. ..$ : NULL
  .. ..$ : NULL
  ..@ x       : num [1:3] 1 2 3
  ..@ factors : list()

> cbind (i = A.nc@i + 1, j = A.nc@j + 1, x = A.nc@x)
     i j x
[1,] 1 1 1
[2,] 3 3 2
[3,] 5 4 3
> all (cbind (i = A.nc@i + 1, j = A.nc@j + 1, x = A.nc@x) == cbind (i, j, x))
[1] TRUE

Answer 2

summary(A)
# 5 x 4 sparse Matrix of class "dgCMatrix", with 3 entries 
#   i j x
# 1 1 1 1
# 2 3 3 2
# 3 5 4 3

您可以轻松传递到as.data.frame或as.matrix：

sparseToVector <- function(x)as.matrix(summary(x))
B <- sparseToVector(A)
## test case:
identical(B,cbind(i,j,x))
# [1] TRUE

Answer 3

将which与arr.ind：

一起使用

idx <- which(A != 0, arr.ind=TRUE)
cbind(idx, A[idx])
#      [,1] [,2] [,3]
# [1,]    1    1    1
# [2,]    3    3    2
# [3,]    5    4    3

如何将稀疏矩阵转换为索引矩阵和非零元素值

3 个答案: