Question

我已经看过一些让我感到困惑的事情，我只发现了这个： Do some programs not accept process substitution for input files?

这部分有帮助，但我真的很想了解完整的故事。我注意到当我使用进程替换时，我的一些R脚本会给出不同的（即错误的）结果。

我试图用测试用例来确定问题：

这个脚本：

#!/usr/bin/Rscript

args  <- commandArgs(TRUE)
file  <-args[1]
cat(file)
cat("\n")
data <- read.table(file, header=F)
cat(mean(data$V1))
cat("\n")

以这种方式生成输入文件：

$ for i in `seq 1 10`; do echo $i >> p; done
$ for i in `seq 1 500`; do cat p >> test; done

引导我：

$ ./mean.R test
test
5.5

$ ./mean.R <(cat test)
/dev/fd/63
5.501476

进一步的测试显示有些线路丢失了...但我想了解原因。 read.table（scan给出相同的结果）是否使用seek？

聚苯乙烯。使用较小的测试文件（100）报告错误：

$./mean.R <(cat test3)
/dev/fd/63
Error in read.table(file, header = F) : no lines available in input
Execution halted

添加＃1：使用经过修改的脚本使用扫描结果是相同的。

Answer 1

我已经编写了这个通用函数，用于在我自己的脚本中打开文件连接：

OpenRead <- function(arg) {

   if (arg %in% c("-", "/dev/stdin")) {
      file("stdin", open = "r")
   } else if (grepl("^/dev/fd/", arg)) {
      fifo(arg, open = "r")
   } else {
      file(arg, open = "r")
   }
}

在您的代码中，将file替换为file <- OpenRead(file)，它应该处理以下所有内容：

./mean.R test
./mean.R <(cat test)
cat test | ./mean.R -
cat test | ./foo.R /dev/stdin

流程替代

1 个答案: