在R中使用LIMMA时使用的数据格式

Question

有人可以给我一个小例子，当我将它导入R时，我导入LIMMA的微阵列数据应该是什么样的？

我试图从微阵列样本中解读差异调节的基因。谢谢。

Answer 1

带有标准化表达水平的标签（或其他）分隔文件，另外还有一个带有探针组ID（或其他基因标识符）的列和一个定义样本的标题 - 一般来说。

要获得所需代码的示例，我建议您检查geo2r生成的脚本（可从任何GEO数据集访问）并阅读limma插图。