有或没有log2数据的批量效果测试和校正？

Question

我正在使用DIA蛋白质组数据。对于批量检测，我使用pvca-package，对于批量校正，使用removeBatchEffect中的LIMMA函数。

我找不到任何信息，是否应该在有或没有log2数据的情况下进行批量效果检测和校正？

我以前使用过log2，但是由于VOON需要非log2数据，所以我想知道批量分析和校正是否也是如此。

感谢您的建议！ 塞巴斯蒂安