如何使用Bioperl运行'mpileup'?
当尝试使用Bio :: Tools :: Run :: Samtools运行mpileup时,我的'mpileup'未注册。我究竟做错了什么?任何指向正确方向的人都会受到赞赏......谢谢你们......
答案 0 :(得分:2)
简短的回答是,您无法使用BioPerl-Run运行mpileup
,因为正如您的错误消息所描述的那样,该命令似乎没有被列为samtools可用的命令。您可能想在bioperl-listserv上提出此问题,希望有人会添加此功能。