从GFF3数据库获取bioperl的属性值

时间:2012-09-24 08:31:43

标签: bioperl

我已经用BioPerl商店对象创建了一个GFF3数据库(BIO:DB:SeqFeature:Store) 我自己从Blastx结果创建了GFF3文件,并创建了一系列我自己的标签作为属性。现在我将从BioPerl为我创建的数据库中获取这些值....

我该怎么办?

请帮忙! 非常感谢你。

1 个答案:

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我发现存在函数在包BIO::SeqFeature::Generic中执行此操作。 最有用的是get_tag_values,它返回一个数组,每个值包含在属性中,并在输入中给出一个特定的标记!

用法:

my @values= $feature->get_tag_values('go');

再见!