我有NetworkX图表。我想知道如何在多个节点之间进行edge contraction。
例如,如果我想收缩X,Y和Z:
_ node A _
_/ | \_
node X --- node Y --- node Z
会变成
node A
|
node XYZ (or whatever X/Y/Z)
图表创建不是问题。有用。我想通过合并具有相同“含义”的节点来减少图形:我称之为“end lvl”的节点(节点名称长度等于7)并且它们链接在一起。
我在NetworkX中找到了缩放功能,所以我尝试使用它:
# edge contraction for same nodes
# for each node, get the links to other nodes "end lvl"
# if there is such a link, it means that these node are
# the sames
#
# copy graph
I = G
for n,d in G.nodes(data=True):
if n in I.nodes():
if len(n) == 7:
# list of nodes adjacent to n : filter only "end lvl" nodes
neighbors = [ node for node in I.neighbors(n) if len(node) == 7 ]
nodes_to_merges = neighbors.append(n)
I = nx.condensation(I,scc=nodes_to_merges)
我转换为JSON时得到的是:
{"directed": true, "graph": [], "nodes": [{"id": 0}], "links": [], "multigraph": false}
有一个问题,你可以看到......
对函数的引用是here。
答案 0 :(得分:4)
怎么样:
add_node(XYZ)
add_edge(XYZ, A)
for edge incident on (X, Y, Z):
v = nodes in edge not in (X, Y, Z, A)
if v:
remove_edge(edge)
add_edge(v, XYZ)
for node in (X, Y, Z):
remove_node(node)
答案 1 :(得分:1)
不是尝试使用nx.condensation(用于收缩强连接组件,而不是一般的节点组),而是使用这些函数:
删除所有折叠节点中的所有节点并重新连接其节点。