Question

我对这一切都比较新，我开始在这里做图像分析教程：http://www.pythonvision.org/basic-tutorial 我已经安装了所有模块但是在遇到障碍之前我没有走得太远。尝试执行pylab.imshow(dna)步骤时，它会返回以下错误：

In [10]: pylab.imshow(dna)
---------------------------------------------------------------------------
TypeError                                 Traceback (most recent call last)
<ipython-input-10-fc86cadb4e46> in <module>()
----> 1 pylab.imshow(dna)

 /usr/lib/pymodules/python2.7/matplotlib/pyplot.pyc in imshow(X, cmap, norm, aspect,    interpolation, alpha, vmin, vmax, origin, extent, shape, filternorm, filterrad, imlim, resample, url, hold, **kwargs)
   2375         ax.hold(hold)
   2376     try:
-> 2377         ret = ax.imshow(X, cmap, norm, aspect, interpolation, alpha, vmin, vmax, origin, extent, shape, filternorm, filterrad, imlim, resample, url, **kwargs)
   2378         draw_if_interactive()
   2379     finally:

/usr/lib/pymodules/python2.7/matplotlib/axes.pyc in imshow(self, X, cmap, norm, aspect, interpolation, alpha, vmin, vmax, origin, extent, shape, filternorm, filterrad, imlim, resample, url, **kwargs)
   6794                        filterrad=filterrad, resample=resample, **kwargs)
   6795 
-> 6796         im.set_data(X)
   6797         im.set_alpha(alpha)
   6798         self._set_artist_props(im)

/usr/lib/pymodules/python2.7/matplotlib/image.pyc in set_data(self, A)
    409         if (self._A.ndim not in (2, 3) or
    410             (self._A.ndim == 3 and self._A.shape[-1] not in (3, 4))):
--> 411             raise TypeError("Invalid dimensions for image data")
    412 
    413         self._imcache =None

TypeError: Invalid dimensions for image data

相当确定我已按照教程中的所有说明进行了写信，但我无法解决是否出错

由于

Answer 1

“它只是保存图像的内容，如dna = mahotas.imread（'dna.jpeg'）类型（dna）给出numpy.ndarray和dna.shape给出（1024,1344,1）”

这就是问题所在，如果你提交3D ndarray，它预计会有3或4个平面（RGB或RGBA）。（读取堆栈跟踪的最后一帧中第410行的代码）。

您只需要使用

删除额外的维度

dna = dna.squeeze()

或

imshow(dna.squeeze())

要查看squeeze正在做什么，请参阅以下示例：

a = np.arange(25).reshape(5, 5, 1)
print a.shape # (5, 5, 1)
b = a.squeeze()
print b.shape # (5, 5)

Answer 2

从 v3.3 开始，此错误不再出现，因为大小为 MxNx1 的 3d 数组现在被强制转换为 MxN 以进行显示。

用pylab.imshow（）显示图像

2 个答案: