我想从Pr(> | t |)列
中提取值library(lsmeans)
warp.lm = lm(breaks ~ wool * tension, data = warpbreaks)
toP<-lsmeans(warp.lm, pairwise ~ wool | tension, glhargs=list())
toP[[2]]
Simultaneous Tests for General Linear Hypotheses
Fit: lm(formula = breaks ~ wool * tension, data = warpbreaks)
Linear Hypotheses:
Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)
A - B | L == 0 16.333 5.157 3.167 0.00797 **
A - B | M == 0 -4.778 5.157 -0.926 0.73187
A - B | H == 0 5.778 5.157 1.120 0.60282
---
Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1
(Adjusted p values reported -- single-step method)
怎么做? class(toP[[2]])
说"summary.glht" "glht"
。 toP [[2]] [9]中有$ pvalues,但toP [[2]] [9] $ pvalues给出NULL
答案 0 :(得分:6)
如果您想了解可以访问给定对象的“元素”,请不要使用class
,请使用names
:
R> names(toP[[2]])
[1] "model" "linfct" "rhs" "coef" "vcov"
[6] "df" "alternative" "type" "test"
在这里,您可以看到有一个名为test
的元素。我们来看看它:
R> names(toP[[2]]$test)
[1] "pfunction" "qfunction" "coefficients" "sigma"
[5] "tstat" "pvalues" "type"
嗯,有一个名为pvalues
的元素。听起来不错。您可以使用以下方式访问它:
R> toP[[2]]$test$pvalues
[1] 0.007954354 0.731843623 0.602840958
attr(,"error")
[1] 7.579683e-05
在这里你获得了你的p值......
获取对象结构的另一种方法是使用str()
。应用于您的案例(str(toP[[2]])
)会导致输出有点长,但可以让您直接确定访问p值的方式。
答案 1 :(得分:2)
你有没有尝试过:
toP[[2]]$test$pvalues