用于组合P值的Stouffer-Liptak方法

Question

我处于需要使用Stouffer-Liptak方法将P.values组合进行荟萃分析的位置。我的数据由一个数据框组成，其中行是基因，列包含P.values。下面的模拟图。

Gene  Study 1  Study 2  Study 3
a     0.03     0.001    0.3
b     0.2      0.1      0.02
c     0.04     0.05     0.03

总共有25000个基因，我需要一段代码，使用Stouffer-Liptak方法为所有25,000个基因产生组合的P.values，每行一个。关于如何使用R和Bioconductor应用此方法的任何指示将不胜感激。

干杯， ANKUR。

Answer 1

MetaDE.rawdata中的MetaDE功能有Stouffer。