具有任务的OpenMP代码的独特性能:1个线程比多个线程表现更好

时间:2012-10-16 20:00:11

标签: c parallel-processing task openmp

我有以下代码,我已经实现了一个显式任务版本:

int waves = N_a + N_b +1;  /*considering N_a == N_b */
#pragma omp parallel firstprivate(a, gap, waves) private(temp, wave, ii, i) shared(np, mp, elements)
    {
#pragma omp master
        {
            for(wave = 0; wave < waves; ++wave) {
                // 0 <= wave < n-1
                if(wave < N_a-1) {
                    elements = wave+1;
                    np = wave+1;
                    mp = 0+1;
                }
                // n-1 <= wave < m
                else if(wave < N_b) {
                    elements = N_a;
                    np = N_a-1+1;
                    mp = wave-(N_a-1)+1;
                }
                // m <= wave < m+n-1
                else {
                    elements = N_a-1-(wave-N_b);
                    np = N_a-1+1;
                    mp = wave-(N_a-1)+1;
                }

                for(ii = 0; ii < elements; ii+=chunk) {
                    min = MIN(elements,ii + chunk);
#pragma omp task firstprivate(ii, np, mp, chunk, elements)
                    {
                        for (i = ii; i < min; i++)
                        {

                        temp[0] = H[(np-i)-1][(mp+i)-1] + similarity(seq_a[a][(np-i)-1],seq_b[a][(mp+i)-1]);
                        temp[1] = H[(np-i)-1][(mp+i)]-gap;
                        temp[2] = H[(np-i)][(mp+i)-1]-gap;
                        temp[3] = 0;
                        H[(np-i)][(mp+i)] = find_array_max(temp,4);
                        }
                    } // task
                } //for loop
 #pragma omp taskwait
            }
        }

    }

奇怪的是,在执行代码时,1个线程的性能要比2个,4个,8个和16个线程的性能好得多。只有一个并行区域,我已经对内部for循环进行了剥离,因此每个“块”数量的元素都将有助于创建任务。

我坚持创建一个任务实现,因为这里的元素值会不断变化,我觉得代码有可能通过高效的任务实现来抵制非结构化并行性。

我在Intel xe12版本编译器上尝试这个。以下是我观察的样本块大小的读数:256和N_a = N_b = 4096:

1个主题:1.237560 2个主题:7.223232 4个主题:4.579173 8个主题:3.663661 16个主题:4.425525

我注意到gcc编译器的类似行为。有人可以为什么一线程的代码比多线程更好。 我也看到N_a = N_b = 1024,2048和8192的相似结果。

感谢。

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

所有代码都由#pragma omp master保护,只允许主线程运行所有计算。你必须删除这个pragma(或者有什么理由吗?)才能看到至少一些缩放。