Question

可能重复：
R - remove rows with NAs in data.frame

我有一个名为sub.new的数据框，其中包含多个列。我正在尝试排除包含NA或blank space“”的所有单元格。
我尝试使用subset()，但它的目标是特定列条件。无论如何都要扫描整个数据框并创建一个没有单元格NA或blank space的子集？

在下面的示例中，只应保留第一行：

# ID               SNP             ILMN_Strand   Customer_Strand
ID1234              [A/G]          TOP           BOT
Non-Specific        NSB (Bgnd)     Green
Non-Polymorphic     NP (A)         Red
Non-Polymorphic     NP (T)         Purple
Non-Polymorphic     NP (C)         Green
Non-Polymorphic     NP (G)         Blue
Restoration         Restore        Green

有什么建议吗？感谢

Answer 1

一个好主意是在进行任何进一步分析之前将所有“”（空白单元格）设置为NA。

如果您正在从文件中读取输入，那么将所有“”强制转换为NAs是一个不错的选择：

foo <- read.table(file="Your_file.txt", na.strings=c("", "NA"), sep="\t") # if your file is tab delimited

如果您已经加载了表格，则可以执行以下操作：

foo[foo==""] <- NA

然后，为了只保留没有NA的行，您可以使用na.omit()：

foo <- na.omit(foo)

或者保留没有NA的列：

foo <- foo[, colSums(is.na(foo)) == 0]

Answer 2

不确切知道你拥有什么样的数据集，所以我提供了一般答案。

x <- c(1,2,NA,3,4,5)
y <- c(1,2,3,NA,6,8)
my.data <- data.frame(x, y)
> my.data
   x  y
1  1  1
2  2  2
3 NA  3
4  3 NA
5  4  6
6  5  8
# Exclude rows with NA values
my.data[complete.cases(my.data),]
  x y
1 1 1
2 2 2
5 4 6
6 5 8

在R中排除空白和NA

2 个答案: