从仅包含零的稀疏矩阵中有效删除列的最佳方法是什么。我有一个矩阵,我已经创建并填充了数据:
matrix = sp.sparse.lil_matrix((100, 100))
我现在希望删除〜最后20列只包含零数据的列。我怎么能这样做?
答案 0 :(得分:10)
如果这只是一个numpy数组,X
,那么你可以说X!=0
会给你一个与X
形状相同的布尔数组,然后你可以索引{ {1}}使用布尔数组,即X
但这是一个稀疏矩阵,它不支持布尔索引,如果你尝试non_zero_entries = X[X!=0]
也不会给你你想要的东西 - 它只返回一个布尔值,它似乎只返回true,如果它们是完全相同的矩阵(在内存中)。
你想要的是来自numpy的X!=0
方法。
nonzero
如果您只想要有非零条目的完整列,那么只需从索引中取第1列。除非您需要考虑重复的索引(如果列中有多个条目):
import numpy as np
from scipy import sparse
X = sparse.lil_matrix((100,100)) # some sparse matrix
X[1,17] = 1
X[17,17] = 1
indices = np.nonzero(X) # a tuple of two arrays: 0th is row indices, 1st is cols
X.tocsc()[indices] # this just gives you the array of all non-zero entries
答案 1 :(得分:1)
这看起来很像,虽然效率不高:
matrix = matrix[0:100,0:80]
答案 2 :(得分:0)
也可以使用
scipy.sparse.find()
获取稀疏矩阵中所有非零元素的位置。
返回值中的[1]
条目是一个numpy列数列。从此数组中获取唯一值将给出非零列的索引。通过这些列对原始稀疏矩阵进行子集,可以得到非零列。
x[:,np.unique(sparse.find(x)[1])]
可以将其扩展为查找至少n 条目的列:
idx = np.unique(sparse.find(x)[1], return_counts=True)
x[:, idx[0][idx[1] > n]]