复对称三对角矩阵的快速矩阵指数

时间:2012-04-12 13:38:25

标签: c++ c matrix blas

基本上我需要以上。我拖着谷歌搜索,找不到实现这个的方法。

我在http://www.guwi17.de/ublas/examples/找到了这个功能,但速度太慢了。我甚至按照MATLAB的例程编写了我自己的Pade近似,但它只比链接中的快一点。

让我感到震惊的是Mathematica能够快速计算矩阵指数(它是否关心矩阵是否是我不知道的tridiag)。

有人能帮忙吗?

编辑:这是我想出的,有什么评论吗?希望对未来的读者有用

我已经离开了c ++一段时间,所以下面的代码可能有点杂乱/慢,所以如果你看到改进,请告诉我。

//Program will compute the matrix exponential expm( i gA ). where i = sqrt(-1) and gA is a matrix

#include <iostream>
#include <gsl/gsl_complex.h>
#include <gsl/gsl_complex_math.h>
#include <gsl/gsl_matrix.h>
#include <gsl/gsl_linalg.h>
#include <gsl/gsl_blas.h>


int main() {

    int n = 100;

    unsigned i = 0;
    unsigned j = 0;

    gsl_complex img = gsl_complex_rect (0.,1.);

    gsl_matrix * gA = gsl_matrix_alloc (n, n);


//Set gA:       
    for ( i = 0; i<n; i++) {
        for ( j = 0; j<=i; j++) {
            if( i == j ) {
                if( i == 0 || i == n-1 ) {
                    gsl_matrix_set (gA, i, j, 1.);
                } else {
                    gsl_matrix_set (gA, i, j, 2.);
                }
            } else if( j == i-1 ) {
                gsl_matrix_set (gA, i, j, 1.);
                gsl_matrix_set (gA, j, i, 1.);
            } else {
                gsl_matrix_set (gA, i, j, 0.);
                gsl_matrix_set (gA, j, i, 0.);
        }
    }
}


//get SVD of gA 
    gsl_matrix * gA_t = gsl_matrix_alloc (n, n);
    gsl_matrix_transpose_memcpy (gA_t, gA);                 

    gsl_matrix * U = gsl_matrix_alloc (n, n);
    gsl_matrix * V= gsl_matrix_alloc (n, n);
    gsl_vector * S = gsl_vector_alloc (n);


    gsl_vector * work = gsl_vector_alloc (n);
    gsl_linalg_SV_decomp (gA_t, V, S, work);
    gsl_vector_free(work);

    gsl_matrix_memcpy (U, gA_t);


//Take exponential of S and form matrix
    gsl_matrix_complex * Sp = gsl_matrix_complex_alloc (n, n);
    gsl_matrix_complex_set_zero (Sp);
    for (i = 0; i < n; i++) {
        gsl_matrix_complex_set (Sp, i, i, gsl_complex_exp ( gsl_complex_mul_real ( img, gsl_vector_get(S, i) ) ) ); // Vector 'S' to matrix 'Sp'
    }

    gsl_matrix_complex * Uc = gsl_matrix_complex_alloc (n, n);


//convert U to a complex matrix for next step   
    for (i = 0; i < n; i++) {
        for ( j = 0; j<n; j++) {
            gsl_matrix_complex_set (Uc, i, j, gsl_complex_rect ( gsl_matrix_get(U, i, j), 0. ) );       
        }
    }


//recombine U S Utranspose  
    gsl_matrix_complex * tA = gsl_matrix_complex_alloc (n, n);
    gsl_matrix_complex * eA = gsl_matrix_complex_alloc (n, n);
    gsl_blas_zgemm (CblasNoTrans, CblasNoTrans, GSL_COMPLEX_ONE, Uc, Sp, GSL_COMPLEX_ZERO, tA);
    gsl_blas_zgemm (CblasNoTrans, CblasTrans, GSL_COMPLEX_ONE, tA, Uc, GSL_COMPLEX_ZERO, eA);


//Print result  
    std::cout << "eA:" << std::endl;
    for (i = 0; i < n; i++)  
        for (j = 0; j < n; j++)
            printf ("%g + %g i\n", GSL_REAL(gsl_matrix_complex_get (eA, i, j)), GSL_IMAG(gsl_matrix_complex_get (eA, i, j)));
    std::cout << "\n" << std::endl;


//Free up
    gsl_matrix_free(gA_t);
    gsl_matrix_free(U);
    gsl_matrix_free(gA);
    gsl_matrix_free(V);
    gsl_vector_free(S);
    gsl_matrix_complex_free(Uc);
    gsl_matrix_complex_free(tA);    
    gsl_matrix_complex_free(eA);    

    return 0;
}        

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

上面的代码我发布到我的问题非常有效。我发现的另一项改进是通过特征值缩放V副本中的列,而不是执行完整的矩阵乘法。由于zgemm是此代码中最慢的部分,因此删除其中一个zgemm函数会将其加速近两倍。我很快就会在这里发布一个完整的代码列表。