有人有方法导入HPLC色谱图原始数据吗?

时间:2012-03-27 19:22:46

标签: r import

我有兴趣在R中探索HPLC原始数据。

我想探索所有频道(3d和4个2d频道)的完整数据。

我正在使用Empower Pro生成数据。

导出格式包括

  • ASCII .arw
  • AIA .cdf
  • OpenLynx .rpt

示例文件位于:

.arw file

.cdf file

此时我无法获取有关文件类型结构的信息。

使用read.csv等工具,似乎文件中不包含3d色谱图数据,或者无法以这种方式导入此数据。

感谢@Ben Bolker,我能够使用“ncdf”软件包打开与.cdf文件的连接,但它也显得很空(文件或导入问题?)。

1 个答案:

答案 0 :(得分:3)

阅读这些数据非常简单:

X <- read.csv(url("http://dl.dropbox.com/u/2499934/raw27796.arw"),skip=2,
              header=FALSE)
plot(X$V1,X$V2,type="l")

除此之外,我对HPLC分析一无所知,但我建议:

library("sos")  ## you may have to install the package first
findFn("HPLC")

希望这有帮助。它确实回答了狭隘提出的问题(“我如何导入这些数据”);也许拥有更多学科领域知识的人可以说出你之后会做些什么。

PS 从一些谷歌搜索,它看起来像“AIA CDF”是NetCDF文件的一种形式; R也有工具来处理这种数据格式(同样,findFn("NetCDF")):另见http://cran.r-project.org/doc/manuals/R-data.html