Question

我正在尝试使用 splines 包中的ns()函数和我使用的泊松GLM来测试颗粒物质浓度（pm.lag0）的重要性健康结果（Freq）：

   > gfit4 = glm(Freq ~ pm.lag0 + ns(date, df=2), family = poisson(), 
                 data = dt,  offset = log(pop))

我收到了这些错误：

Error in splineDesign(knots, x, ord, derivs, outer.ok = outer.ok) : 
  must have at least 'ord' knots
In addition: Warning message:
In sort(as.numeric(knots)) : NAs introduced by coercion

这不是ns()的有效用途吗？有人可以帮我解码这个错误信息吗？ R提供的样条文档似乎与此错误不匹配（?ns）。

Answer 1

我无法理解为什么原则上无法在ns()中使用glm()的原因。要了解原因，请研究ns()在公式中的作用。来自?ns

> model.frame(weight ~ ns(height, df = 5), data = women)
   weight ns(height, df = 5).1 ns(height, df = 5).2 ns(height, df = 5).3 ns(height, df = 5).4 ns(height, df = 5).5
1     115         0.000000e+00         0.000000e+00         0.000000e+00         0.000000e+00         0.000000e+00
2     117         7.592323e-03         0.000000e+00        -8.670223e-02         2.601067e-01        -1.734045e-01
3     120         6.073858e-02         0.000000e+00        -1.503044e-01         4.509132e-01        -3.006088e-01
4     123         2.047498e-01         6.073858e-05        -1.677834e-01         5.033503e-01        -3.355669e-01
5     126         4.334305e-01         1.311953e-02        -1.324404e-01         3.973211e-01        -2.648807e-01
6     129         6.256681e-01         8.084305e-02        -7.399720e-02         2.219916e-01        -1.479944e-01
7     132         6.477162e-01         2.468416e-01        -2.616007e-02         7.993794e-02        -5.329196e-02
8     135         4.791667e-01         4.791667e-01         1.406302e-02         2.031093e-02        -1.354062e-02
9     139         2.468416e-01         6.477162e-01         9.733619e-02         2.286023e-02        -1.524015e-02
10    142         8.084305e-02         6.256681e-01         2.707683e-01         6.324188e-02        -4.052131e-02
11    146         1.311953e-02         4.334305e-01         4.805984e-01         1.252603e-01        -5.240872e-02
12    150         6.073858e-05         2.047498e-01         5.954160e-01         1.989926e-01         7.809246e-04
13    154         0.000000e+00         6.073858e-02         5.009718e-01         2.755102e-01         1.627794e-01
14    159         0.000000e+00         7.592323e-03         2.246113e-01         3.520408e-01         4.157556e-01
15    164         0.000000e+00         0.000000e+00        -1.428571e-01         4.285714e-01         7.142857e-01

这表明它为height变量的自然样条线提供了B样条基础。这里没什么特别的。

因此，我怀疑您的date变量不是数字，或者R不能通过将其强制为数字而不引入NA来处理这些变量 - 请参阅警告消息。如果没有可重复的示例和数据信息，则无法分辨出来！

此外，您可能希望查看 mgcv 包中的gam()函数，其中推荐包随R一起发布。它旨在以您描述的方式拟合半参数模型，并且可以包括参数项以及其他项的平滑/样条。该软件包相当全面，可以适应大量类型的样条。请参阅手册。

Answer 2

阅读ns函数?ns的帮助页面，在其包含的df参数部分下：

One can supply ‘df’ rather than knots;
          ‘ns()’ then chooses ‘df - 1 - intercept’ knots at suitably
          chosen quantiles of ‘x’

并且由于你指定了2个自由度并且没有压制默认拦截，这意味着你要求它适合一个0节的样条，它不知道该怎么做。尝试为df指定一个更大的数字，它应该适合你。

使用glm（）里面的splines包中的ns（）函数

2 个答案: