Question

我想在unix中将两个文件合并为一列。

我有file_a：

subjectid name age  
12 Jane 16  
24 Kristen 90  
15 Clarke 78  
23 Joann 31

我有另一个file_b：

subjectid prob_disease  
12 0.009  
24 0.738  
15 0.392  
23 1.2E-5

我想在命令行中合并这些文件。我想通过subjectid合并文件a和b。由于每个文件大约有200万行，我试过R但由于数据量大而冻结，有人可以帮我在linux中做这个吗？期望的输出：

subjectid prob_disease name age  
12 0.009 Jane 16  
24 0.738 Kristen 90   
15 0.392 Clarke 78  
23 1.2E-5 Joanna 31

请帮忙谢谢！

Answer 1

结帐join(1)。在您的情况下，您甚至不需要任何标志：

$ join file_b file_a
subjectid prob_disease name age
12 0.009 Jane 16
24 0.738 Kristen 90
15 0.392 Clarke 78
23 1.2E-5 Joann 31

Answer 2

您正在寻找join命令：

$ cat test.1
12 Jane 16
24 Kristen 90
15 Clarke 78
23 Joann 31 
$ cat test.2
12 0.009
24 0.738
15 0.392
23 1.2E-5 
$ join -j1 -o 2.1,2.2,1.2,1.3  <(sort test.1) <(sort test.2)
12 0.009 Jane 16
15 0.392 Clarke 78
23 1.2E-5 Joann 31
24 0.738 Kristen 90
$

在unix中通过单个列合并两个文件

2 个答案: