Question

将几个SciPy函数记录为采用“scipy.spatial.distance.pdist返回的精简距离矩阵”。现在，检查显示pdist返回的是距离矩阵的上部非对角线部分的行主要1D阵列形式。这一切都很好，很自然而且很明显，但它是在任何地方记录或定义的吗？我宁愿不假设任何关于突然改变的数据结构。（当然，它可能没有很多东西可以改变，但我想有一种可能性就是将数组包装在允许类似矩阵索引的对象中。）

Answer 1

老实说，对于scipy用户或dev列表来说这是一个更好的问题，因为它是关于scipy的未来计划。

但是，scipy.spatial.pdist和scipy.spatial.squareform的文档字符串中都严格记录了该结构。

E.g。 pdist：

Returns a condensed distance matrix Y.  For
    each :math:`i` and :math:`j` (where :math:`i<j<n`), the
    metric ``dist(u=X[i], v=X[j])`` is computed and stored in the
    :math:`ij`th entry.

    See ``squareform`` for information on how to calculate the index of
    this entry or to convert the condensed distance matrix to a
    redundant square matrix.

由于这一点，以及scipy.spatial中的许多其他功能都希望以这种形式存在距离矩阵，我会严重怀疑它会在没有一些折旧警告和公告的情况下发生变化。

scipy本身的模块（与scipy的scikits相对）是相当稳定的，并且在进行更改时会对向后兼容性进行大量考虑（因此，有很多scipy中遗留下来的“遗骸”：例如，核心scipy模块只是在几个函数上具有不同的默认值的事实。）。

SciPy的压缩距离矩阵的格式/结构是否稳定？

1 个答案: