Question

我正在尝试使用R生成2个文件，第一个实际生成的文件相当不错，但第二个文件告诉我以下内容：

conteo_correlaciones.c：3：15：错误：R.h：没有这样的文件或目录 conteo_correlaciones.c：4：24：错误：Rinternals.h：没有这样的文件或目录conteo_correlaciones.c：31：错误：预期'='，'，'，';'， 'countcorrelations'之前的'asm'或'属性'

Rh和Rinternals.h都是从R目录复制的，它们与其他文件在同一个目录中，但是我无法通过这个错误，这些文件被这样的包调用：

#include <R.h>
#include <Rinternals.h>

我在终端上做的是：

R CMD SHLIB conteo_correlaciones.c

效果很好并为我生成正确的文件，并且：

gcc -dynamiclib conteo_correlaciones.c -o conteo_correlaciones.so

这引发了我上述错误。知道可能是什么？

Answer 1

R CMD SHLIB添加所有适当的标志来编译代码。您不能（可靠地）“手动”编译代码。 R CMD SHLIB已经创建了所有必需的文件，因此您无需自己运行gcc。

例如，这是R CMD SHLIB运行的内容：

$ R CMD SHLIB foo.c
gcc -arch x86_64 -std=gnu99 -I/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include 
  -I/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include/x86_64 
  -I/usr/local/include    -fPIC  -g -O2 -c foo.c -o foo.o
gcc -arch x86_64 -std=gnu99 -dynamiclib -Wl,-headerpad_max_install_names
  -undefined dynamic_lookup -single_module -multiply_defined suppress
  -L/usr/local/lib -o foo.so foo.o -F/Library/Frameworks/R.framework/..
  -framework R -Wl,-framework -Wl,CoreFoundation

正如您所看到的，创建正确的二进制文件需要很长的标记列表。第一行是编译，第二行是链接。正如你所看到的那样，它甚至都不像你想要的那样“手工”。

至于确切的错误 - 它只是你会得到的许多错误中的一个 - 在上面的例子中，你需要包含R的包含-I的路径。还有其他人，所以你不想去那里，只要坚持R CMD SHLIB。

Answer 2

你必须改变

#include <R.h>
#include <Rinternals.h>

到

#include "R.h"
#include "Rinternals.h"

如果头文件与代码文件在同一目录中。或者您可以将正确的包含路径添加到gcc命令行（例如-I/usr/share/R/include）。

Answer 3

首先找到存储R.h的位置（如果已从源安装R，则可以在/ usr / include或/ usr / local / include或任何位置）。在我的情况下，它位于/ home / user / R / include /：

然后导出路径：

export CPATH=/home/user/R/include/
export C_INCLUDE_PATH=/home/user/R/include/
export CPLUS_INCLUDE_PATH=/home/user/R/include/
export GCC_INCLUDE_DIR=/home/user/R/include/

然后编译应运行正常。

R在尝试编译时抛出错误

3 个答案: