Question

我找不到一种非常直观的方式来做最基本的事情;使用我的基本变量创建汇总表。我发现最好的方法是使用tapply：

seed(200)
my_stats <- function(x){
    if (is.factor(x)){
        a <- table(x, useNA="no")
        b <- round(a*100/sum(a),2)

        # If binary
        if (length(a) == 2){
            ret <- paste(a[1], " (", b[1], " %)", sep="")
        }
        return(ret)
    }else{
        ret <- mean(x, na.rm=T)
        if (ret < 1){
            ret <- round(ret, 2)
        }else{
            ret <- round(ret)
        }
        return(ret)
    }
}

library(rms)
groups <- factor(sample(c("Group A","Group B"), size=51, replace=T))
a <- 3:53 
b <- rnorm(51)
c <- factor(sample(c("male","female"), size=51, replace=T))

res <- rbind(a=tapply(a, groups, my_stats),
      b=tapply(b, groups, my_stats),
      c=tapply(c, groups, my_stats))
latex(latexTranslate(res))

res包含：

> res
  Group A     Group B       
a "28"        "28"          
b "-0.08"     "-0.21"       
c "14 (56 %)" "14 (53.85 %)"

现在这可行，但它似乎非常复杂，而不是最优雅的解决方案。我试图搜索如何创建描述性表，但所有关注的只是单个变量或同类变量的table（），prop.table（），summary（）。

我的问题：是否有一个包装/功能可以轻松创建一个好看的乳胶表？如果是这样，请提示如何获得上述结果。

谢谢！

Answer 1

你所要求的是有点开放，因为你有可能不同意我对“好看的LaTeX表”的构成。

例如，我可能更喜欢按行而不是按列组织：

require(plyr)
require(xtable)
dat <- data.frame(a,b,c,groups)
xtable(ddply(dat,.(groups),summarise,a = my_stats(a),
                                     b = my_stats(b),
                                     c = my_stats(c)))


\begin{table}[ht]
\begin{center}
\begin{tabular}{rlrrl}
  \hline
 & groups & a & b & c \\ 
  \hline
1 & Group A & 28.00 & 0.14 & 13 (52 \%) \\ 
  2 & Group B & 28.00 & -0.00 & 13 (50 \%) \\ 
   \hline
\end{tabular}
\end{center}
\end{table}

当然，如果您查看?xtable和?print.xtable，其中大部分内容都是可自定义的。

Answer 2

如果重写函数，它总是返回一个字符串（它有时返回一个字符串，有时是一个数字，有时是NULL），您可以在data.frame上调用ddply，而无需指定所有列。

f <- function(u) {
  res <- "?" 
  if(is.factor(u) || is.character(u)) {
    u <- table(u, useNA = "no")
    if (length(u) == 0 || sum(u) == 0) { res <- "NA" }
    else { res <- sprintf( "%0.0f%%", 100 * u[1] / sum(u) ) }
  } else {
    u <- mean(u, na.rm=TRUE)
    if(is.na(u)) { res <- "NA" }
    else { res <- sprintf( ifelse( abs(u) < 1, "%0.2f", "%0.0f" ), u ) }
  }
  return( res )
}
# Same function, for data.frames
g <- function(d) do.call( data.frame, lapply(d, f) )

library(plyr)
ddply(data.frame(a,b,c), .(groups), g)

由于您需要LaTeX表，您可能还需要尝试以下操作，它不会对数据进行分组，但会为数字变量添加迷你图直方图。

library(Hmisc)
latex(describe(d), file="")

Answer 3

查看tables包以寻找可能使这更简单的另一种方法。

Answer 4

如果您想创建包含catergorical和连续变量的汇总表，您应该查看包＆＃39; tableone＆＃39;。

以下是它可以做https://rpubs.com/kaz_yos/tableone-vignette的例子。以下是pdf文档：https://cran.r-project.org/web/packages/tableone/tableone.pdf

我希望这会有所帮助。

迈克

描述性表 - 如何创建包含数字和分类变量的表

4 个答案: