我编写了一个代码,用F#执行一些基本的矩阵计算。我想知道这段代码是否有一些可能的改进,以减少计算时间。
实际上,所执行的操作是非常基本的(主要是2个矩阵的乘法和转置),但是矩阵的大小很高(大约10000 * 100000
),导致计算持续时间很长(几个小时)。
我的问题/评论如下:
以下是算法:
// I use the #time function to calculate the calculation duration of the algorithm
#time
#r "Microsoft.Office.Interop.Excel"
#r "FSharp.PowerPack.dll"
open System
open System.IO
open Microsoft.FSharp.Math
open System.Collections.Generic
// Algorithm
let matrixCalculation (matA : matrix) (matB : matrix) (matC : matrix) =
// First step : Renamed the matrix A and B size to initialize the matrix "matrixCalcul"
let nbrOfElementsA = matA.NumRows
let nbrOfElementsB = matB.NumRows
let nbrOfCaracteristicsA = matA.NumCols
let nbrOfCaracteristicsB = matB.NumCols
// Second step : MatB has to be transposed
let tmatB = matB.Transpose
// Initialisation of the final output named matrixCalcul. A weighted vector is also initialised
let mutable matrixCalcul = Matrix.create (nbrOfElementsA + 1) (nbrOfElementsB + 1) 0.
let mutable weightedVector = Matrix.create nbrOfCaracteristicsA 1 0.
// The first column of matA and matB represents IDs, and are "copy/past" in matrixCalcul's first colum and first row respectively
matrixCalcul.[1.. ,0..0] <- matA.[0..,0..0]
matrixCalcul.[0..0,1 ..] <- matB.[0..,0..0].Transpose
// Then the core of the matrix named "matrixCalcul" can be calculated
for j = 0 to (nbrOfElementsB - 1) do
weightedVector <- matC * tmatB.[1..(nbrOfCaracteristicsB - 1),0..(nbrOfElementsB-1)].Columns(j,1)
for i = 0 to (nbrOfElementsA - 1) do
let mutable acc = matA.[0..(nbrOfElementsA - 1),1..(nbrOfCaracteristicsA-1)].Rows(i,1) * weightedVector
matrixCalcul.[i+1,j+1] <- (acc.[0,0])
matrixCalcul
// Two matrix generators (one for matA and matB and another one for matC)
let matrixTestGeneratorAandB nbrOfElements nbrOfCaracteristics =
let matrixTestGeneratedAandB = Matrix.create nbrOfElements nbrOfCaracteristics 0.
|> Matrix.mapi (fun i j value -> if j = 0 then float(i + 1) elif j % 2 = 0 then 1. else 0.)
matrixTestGeneratedAandB
let matrixTestGeneratorC nbrOfElements nbrOfCaracteristics =
let matrixTestGeneratedC = Matrix.create nbrOfElements nbrOfCaracteristics 0.
|> Matrix.mapi (fun i j value -> if j = 0 then 0. elif j % 2 = 0 then 1. else 0.)
matrixTestGeneratedC
// Generation of matrixA, matrixB and matrixC
let matrixA = matrixTestGeneratorAandB 100 179
let matrixB = matrixTestGeneratorAandB 100 639
let matrixC = matrixTestGeneratorC 178 638
// Calculation
matrixCalculation matrixA matrixB matrixC
基本上,计算持续时间大约为2秒,但如果您将matrixA
和matrixB
的数量更改为10000
,则可能需要一小时。仅供参考,在我的算法中,matrixC
的大小将保持不变,只有矩阵A和B可以有越来越多的行。
如果你有任何改进的想法,我会接受它。
答案 0 :(得分:9)
从您的代码中,很难理解您要实现的目标。我认为您的意思是按如下方式计算矩阵d[0..m, 0..n]
:
+---------+-------------------------+
| 0.0 | b00 b10 ...... b(n-1)0 |
+---------+-------------------------+
| a00 | d11 d12 ...... d1n |
| a10 | d21 d22 ...... d2n |
| ... | ... ... ...... ... |
| ... | ... ... ...... ... |
| ... | ... ... ...... ... |
| a(m-1)0 | dm1 dm2 ...... dmn |
+---------+-------------------------+
其中核心部分(内部矩阵d[1..m, 1..n]
)是三个矩阵的乘法matA1
(修剪第一列后matA
),matC
和{{1修剪第一列并转置后的matB1
。
要理解矩阵运算,一个好的方法就是对矩阵大小进行推理。让matB
,ra
,ca
,rb
,cb
和rc
表示cc
中的行数和列数,分别为matA
和matB
。乘法是三个大小为matC
,ra x (ca-1)
和rc x cc
的矩阵之间的乘法;这只有在(cb-1) x rb
和rc = ca-1
时才有意义。我们得到了大小为cc = cb-1
的结果矩阵d
。
这是我尝试不使用任何(ra+1) x (rb+1)
循环:
for
我已经使用尺寸为200x279,200x1279和278x1238的let calculate (matA : matrix) (matB : matrix) (matC : matrix) =
let ra = matA.NumRows
let ca = matA.NumCols
let rb = matB.NumRows
let cb = matB.NumCols
let matrixCalcul = Matrix.zero (ra+1) (rb+1)
matrixCalcul.[1.., 0..0] <- matA.[0.., 0..0]
matrixCalcul.[0..0, 1..] <- matB.[0.., 0..0].Transpose
matrixCalcul.[1.., 1..] <- (matA.Columns(1, ca-1) * matC) * matB.Columns(1, cb-1).Transpose
matrixCalcul
,matA
和matB
进行了测试。两个版本产生相同的结果,我的函数比原始版本快matC
。这有很多原因,但一般来说,矢量化版本在矩阵计算方面具有更好的性能。