Question

我无法在python中以我喜欢的形式获取数据。

基本上我有一个程序可以读取二进制数据并提供绘制和分析所述数据的功能。

我的数据有主要标题，然后是副标题，可以是任意数量的不同数据类型。

我希望能够访问我的数据，例如：

>>> a = myDatafile.readit()
>>> a.elements.hydrogen.distributionfunction
(a big array)
>>> a.elements.hydrogen.mass
1
>>> a.elements.carbon.mass
12

但直到运行时我才知道原子的名称。

我尝试过使用namedtuple，例如在我读完所有原子名称之后：

self.elements = namedtuple('elements',elementlist)

其中elementlist是一个字符串列表，例如（'hydrogen'，'carbon'）。但问题是我无法使用例如嵌套这些：

for i in range(0,self.nelements):
    self.elements[i] = namedtuple('details',['ux','uy','uz','mass','distributionfunction'])

然后能够通过例如

访问这些值

self.elements.electron.distributionfunction.

也许我这样做完全错了。我对python缺乏经验。我知道如果我不想动态地命名变量，这将很容易做到。

我希望我已经清楚地了解了我想要实现的目标！

Answer 1

在不知道您的数据的情况下，我们只能提供通用解决方案。

考虑前两行包含标题和子标题，以某种方式读取它确定了层次结构。您所要做的就是创建一个分层字典。

例如，扩展您的示例

data.elements.hydrogen.distributionfunction
data.elements.nitrogen.xyzfunction
data.elements.nitrogen.distributionfunction
data.compound.water.distributionfunction
data.compound.hcl.xyzfunction

所以我们必须创建一个字典

{'data':{'elements':{'hydrogen':{'distributionfunction':<something>}
                     'nitrogen':{'xyzfunction':<something>,
                           'distributionfunction':<something>}
                }
       compound:{'water':{'distributionfunction':<something>}
                 'hcl':{'xyzfunction':<something>}
                }
       }
 }

如何填充字典取决于现在很难说的数据。但是你应该从标题填充字典的键，不知何故你必须将数据映射到字典的空槽中的相应值。

填充地图后，您可以将其作为

进行访问

 yourDict['data']['compound']['hcl']['xyzfunction']

Answer 2

如果您的元素名称是动态的并且是在运行时从数据中获取的，那么您可以将它们分配给dict并像这样访问

elements['hydrogen'].mass

但是如果你想要点分表示法，你可以在运行时创建属性，例如

from collections import namedtuple

class Elements(object):
    def add_element(self, elementname, element):
        setattr(self, elementname, element)

Element = namedtuple('Element', ['ux','uy','uz','mass','distributionfunction'])

elements = Elements()
for data in [('hydrogen',1,1,1,1,1), ('helium',2,2,2,2,2), ('carbon',3,3,3,3,3)]:
    elementname = data[0]
    element = Element._make(data[1:])
    elements.add_element(elementname, element)

print elements.hydrogen.mass
print elements.carbon.distributionfunction

这里我假设你拥有的数据，但是使用任何其他格式的数据你可以做类似的技巧

Answer 3

这是一种从嵌套数据递归创建命名元组的方法。

from collections import Mapping, namedtuple


def namedtuplify(mapping, name='NT'):  # thank you https://gist.github.com/hangtwenty/5960435
    """ Convert mappings to namedtuples recursively. """
    if isinstance(mapping, Mapping):
        for key, value in list(mapping.items()):
            mapping[key] = namedtuplify(value)
        return namedtuple_wrapper(name, **mapping)
    elif isinstance(mapping, list):
        return [namedtuplify(item) for item in mapping]
    return mapping

def namedtuple_wrapper(name, **kwargs):
    wrap = namedtuple(name, kwargs)
    return wrap(**kwargs)


stuff = {'data': {'elements': {'hydrogen': {'distributionfunction': 'foo'}, 
  'nitrogen': {'xyzfunction': 'bar', 
    'distributionfunction': 'baz'}
  },
  'compound': {'water': {'distributionfunction': 'lorem'}, 
    'hcl': {'xyzfunction': 'ipsum'}}}
 }

example = namedtuplify(stuff)

example.data.elements.hydrogen.distributionfunction  # 'foo'

Answer 4

我对嵌套json有同样的问题，但是需要能够使用pickle将输出序列化，而pickle不喜欢你动态创建对象。

我已经采取了@ bren的答案并对其进行了增强，以便生成的结构可以用pickle进行序列化。你必须保存对你为globals创建的每个结构的引用，以便pickle能够密切关注它们。

##############################################
class Json2Struct:
    '''
    Convert mappings to nested namedtuples

    Usage:
        jStruct = Json2Struct('JS').json2Struct(json)
    '''
##############################################

    def __init__(self, name):
        self.namePrefix = name
        self.nameSuffix = 0


    def json2Struct(self, jsonObj):  # thank you https://gist.github.com/hangtwenty/5960435
        """ 
        Convert mappings to namedtuples recursively. 
        """
        if isinstance(jsonObj, Mapping):
            for key, value in list(jsonObj.items()):
                jsonObj[key] = self.json2Struct(value)
            return self.namedtuple_wrapper(**jsonObj)
        elif isinstance(jsonObj, list):
            return [self.json2Struct(item) for item in jsonObj]
        return jsonObj


    def namedtuple_wrapper(self, **kwargs):
        self.nameSuffix += 1
        name = self.namePrefix + str(self.nameSuffix)

        Jstruct = namedtuple(name, kwargs)
        globals()[name] = Jstruct

        return Jstruct(**kwargs)

下面的示例应该如下工作，也可以是可序列化的：

stuff = {'data': {'elements': {'hydrogen': {'distributionfunction': 'foo'}, 
  'nitrogen': {'xyzfunction': 'bar', 
    'distributionfunction': 'baz'}
  },
  'compound': {'water': {'distributionfunction': 'lorem'}, 
    'hcl': {'xyzfunction': 'ipsum'}}}
 }

example = Json2Struct('JS').json2Struct(stuff)

example.data.elements.hydrogen.distributionfunction  # 'foo'

与namedtuple嵌套

4 个答案: