Question

我想运行带有日志链接和偏移量的高斯GLM。出现以下问题：

y <- c(1,1,0,0)
t <- c(5,3,2,4)

没问题：

exp(coef(glm(y~1 +  offset(log(t)), family=poisson)))

family=gaussian，需要指定起始值，它可以在这里工作：

exp(coef(glm(y~1, family=gaussian(link=log), start=0)))

但在这里不起作用：

exp(coef(glm(y~1 +  offset(log(t)), family=gaussian(link=log), start=0)))

eval中的错误（expr，envir，enclos）：找不到有效的起始值：请指定一些“

有没有人看到什么是错的（希望只是在我的编码中）？

Answer 1

我看起来start在offset出现时无法识别。您正尝试在y值-Inf中取0的日志。在glm没有给予帮助的情况下寻找解决方案时，start显然无法解决这个问题。 y值中的小扰动将允许解决方案。

exp(coef(glm(I(y+.Machine$double.eps)~1 + offset(log(t)), family=gaussian(link=log))))
(Intercept) 
  0.1481481

Answer 2

以下是一些考古学的结果，它解释了glm函数内部正在发生的事情：

调试（使用debug("glm")）并单步执行该功能表明它在以下调用时失败：

if (length(offset) && attr(mt, "intercept") > 0L) {
  fit$null.deviance <- eval(call(if (is.function(method)) "method" else method, 
    x = X[, "(Intercept)", drop = FALSE], y = Y, weights = weights, 
    offset = offset, family = family, control = control, 
    intercept = TRUE))$deviance
}

这是尝试计算模型的零偏差。它仅评估是否存在截距项和偏移项（我不确定原因;可能是前一次调用glm计算的默认空值偏差在这种情况下是错误的并且必须重新计算？）。它调用glm.fit（默认值method），但没有起始值，因为对于仅限拦截模型，这些通常是不必要的。

现在在glm.fit内部进行调试，看看会发生什么：我们进入

  if (is.null(etastart) && is.null(start) && is.null(mustart) && 
    ((family$link == "inverse" && any(y == 0)) || (family$link == 
        "log" && any(y <= 0))))
    stop("cannot find valid starting values: please specify some")

我们看到因为没有传递起始值，因为使用了日志链接，并且因为某些y值等于零，所以拟合失败。因此，如果（并且仅当？）指定了偏移量和截距，使用了日志链接，并且响应中没有值，则应该发生这种情况。

如果你dump("glm",file="glmtemp.R");添加行

    start = start[1], etastart = etastart[1], mustart = mustart[1],

适合空偏离的调用（即上面所示的调用）;和source("glmtemp.R")，似乎工作正常......我认为这应该是一个合理的通用解决方案。如果有人想在R开发列表中提出这个问题，请随意。

glm起始值不接受log-link

2 个答案: