在Python脚本中嵌入程序

Question

我创建了一个程序，允许用户输入有关DNA扭曲，转弯和位置以及其他信息的信息。输出是一个PDB文件，但是，我想在程序中的.pdb查看器中显示.pdb文件，似乎无法知道如何。所需的应用程序是Chimera（http://www.cgl.ucsf.edu/chimera/）或瑞士（http://spdbv.vital-it.ch/）。

Answer 1

根据您希望集成的紧密程度，一个像样的开始可能就像使用python外部调用Chimera或瑞士一样简单：

import subprocess
subprocess.Popen(["C:/Path/To/Chimera/bin/chimera.exe", "--stereo",  "seq", "c:/Path/to/pdb/you/created/protease.pdb"])

这会导致Chimera窗口弹出然后加载并渲染您的pdb，但保持您的应用程序处于活动状态并在后台运行（如果您希望程序等待外部程序关闭，请使用subprocess.call来代替。）

（顺便说一下，子流程是更新的方法。os.system和os.exec*是不推荐使用的方法，但仍会得到类似的结果。）