我想将一个函数应用于R中向量的渐进子集。我已经查看了我能找到的内容,并且应用和朋友不在那里,并且rollapply不适用于直向量,仅zoo / ts对象。
vapply <- function(x, n, FUN=sd) {
v <- c(rep(NA, length(x)))
for (i in n:length(x) ) {
v[i] <- FUN(x[(i-n+1):i])
}
return(v)
}
内置的内容是否相同?有没有更好的方法呢?我试图避免对第三方库的依赖,因为我需要将代码独立分发。
答案 0 :(得分:3)
通过选择功能名称,我只是想在内部制作一个实际使用vapply
的版本:)
......在下面的例子中,它的速度提高了大约50%。但这当然在很大程度上取决于在FUN中完成了多少工作......
# Your original version - renamed...
slideapply.org <- function(x, n, FUN=sd) {
v <- c(rep(NA, length(x)))
for (i in n:length(x) ) {
v[i] <- FUN(x[(i-n+1):i])
}
return(v)
}
slideapply <- function(x, n, FUN=sd, result=numeric(1)) {
stopifnot(length(x) >= n)
FUN <- match.fun(FUN)
nm1 <- n-1L
y <- vapply(n:length(x), function(i) FUN(x[(i-nm1):i]), result)
c(rep(NA, nm1), y) # Why do you want NA in the first entries?
}
x <- 1:2e5+0 # A double vector...
system.time( a <- slideapply.org(x, 50, sum) ) # 1.25 seconds
system.time( b <- slideapply(x, 50, sum) ) # 0.80 seconds
identical(a, b) # TRUE