如果图像数据形状改变,则使用imshow设置正确的限制

时间:2011-09-15 15:40:45

标签: image matplotlib rotation reshape

我有一个3D数组,前两个维度是空间的,所以说(x,y)。第三维包含特定于点的信息。

print H.shape  # --> (200, 480, 640)  spatial extents (200,480)

现在,通过在第三维中选择某个平面,我可以使用

显示图像
imdat = H[:,:,100]    # shape (200, 480)
img = ax.imshow(imdat, cmap='jet',vmin=imdat.min(),vmax=imdat.max(), animated=True, aspect='equal')

我想现在旋转立方体,以便从(x,y)切换到(y,x)。

    H = np.rot90(H)          # could also use H.swapaxes(0,1) or H.transpose((1,0,2)) 
    print H.shape    # --> (480, 200, 640)

现在,当我打电话:

imdat = H[:,:,100]   # shape (480,200)
img.set_data(imdat)
ax.relim()
ax.autoscale_view(tight=True)

我的行为很怪异。沿着行的图像显示直到第200行的数据,然后它是黑色的直到y轴的末端(480)。 x轴从0延伸到200并显示旋转的数据。现在,另一个旋转90度,图像正确显示(当然只旋转180度)

在我看来,在旋转数据之后,轴限制,(或图像范围?)或某些东西没有正确刷新。有人可以帮忙吗?

PS:为了沉迷于糟糕的黑客行为,我还尝试在每次轮换后重新生成一个新图像(通过调用ax.imshow),但我仍然会得到相同的行为。

1 个答案:

答案 0 :(得分:4)

下面我列出了您的问题的解决方案。方法resetExtent使用数据和图像将范围显式设置为所需的值。希望我正确地模仿了预期的结果。

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

def resetExtent(data,im):
    """
    Using the data and axes from an AxesImage, im, force the extent and 
    axis values to match shape of data.
    """
    ax = im.get_axes()
    dataShape = data.shape

    if im.origin == 'upper':
        im.set_extent((-0.5,dataShape[0]-.5,dataShape[1]-.5,-.5))
        ax.set_xlim((-0.5,dataShape[0]-.5))
        ax.set_ylim((dataShape[1]-.5,-.5))
    else:
        im.set_extent((-0.5,dataShape[0]-.5,-.5,dataShape[1]-.5))
        ax.set_xlim((-0.5,dataShape[0]-.5))
        ax.set_ylim((-.5,dataShape[1]-.5))

def main():
    fig = plt.gcf()
    ax = fig.gca()

    H = np.zeros((200,480,10))
    # make distinguishing corner of data
    H[100:,...] = 1
    H[100:,240:,:] = 2

    imdat = H[:,:,5]
    datShape = imdat.shape

    im = ax.imshow(imdat,cmap='jet',vmin=imdat.min(),
                    vmax=imdat.max(),animated=True,
                    aspect='equal',
                    #                origin='lower'
                    )

    resetExtent(imdat,im)

    fig.savefig("img1.png")

    H = np.rot90(H)

    imdat = H[:,:,0]
    im.set_data(imdat)
    resetExtent(imdat,im)

    fig.savefig("img2.png")

if __name__ == '__main__':
  main()

此脚本生成两个图像: 首先不旋转: enter image description here 然后旋转: enter image description here

我认为只是明确地调用set_extent会执行resetExtent所做的一切,因为如果'autoscle'为True,它应调整轴限制。但由于某些未知原因,单独调用set_extent并不起作用。