使用rpy2 eval表达的指导

时间:2011-08-12 00:37:34

标签: python r rpy2 cran

我是R和rpy2的新手。我试图移植以下示例

library(MASS)  # for eqscplot  
data(topo, package="MASS")  
topo.kr <- surf.ls(2, topo)  
trsurf <- trmat(topo.kr, 0, 6.5, 0, 6.5, 50)  

到rpy2。

到目前为止我已经

import  rpy2.robjects as robjects
robjects.r('library(spatial)')  
f1 = robjects.r['surf.ls']  
x = robjects.IntVector([1,2,3])  
y = robjects.IntVector([1,2,3])  
z = robjects.IntVector([1,30,3])  
res = f1(2, x,y,z)  

我认为结果应为res。但是,当我使用res打印print(res.r_repr())时,我得到一个我无法评估的表达式。 非常感谢任何帮助。

2 个答案:

答案 0 :(得分:2)

然后问题更多:如何将R列表转换为Python字典(与评估表达式几乎没有关系)。 使用rpy2-2.2.x(和2.3-dev):

from rpy2.robjects.vectors import ListVector
# make an R list
l = ListVector({'a': 1, 'b': 'b'})

# get a Python dict out of an R list
dict(l.iteritems())

答案 1 :(得分:1)

您的代码运行正常。我认为您只是在访问结果时遇到问题。生成的“res”对象本质上是一个R列表。我会把它转换成相应的Python字典。

rListObj = {}
for key,val in zip(robjects.r.names(res),res):
  rListObj[key] = [i for i in val] #R Vector to List

结果:

{'f': [1.0, 1.0, 1.0, -1.0, 0.0, 1.0, 1.0, 0.0, 1.0, -1.0, 0.0, 1.0, 1.0, 0.0, 1.0, 1.0, 0.0, 1.0], 'rx': [1, 3], 'ry': [1, 3], 'np': [2], 'beta': [0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0], 'r': [-1.7320508075688772, -1.6729239521451333e-16, -1.4142135623730951, -1.1547005383792512, -5.187907395343139e-17, -0.8164965809277259, -1.6729239521451333e-16, -1.4142135623730951, 3.415236843329339e-17, nan, -1.1547005383792512, -5.187907395343139e-17, -0.8164965809277259, nan, 0.0, -1.1547005383792512, -5.187907395343139e-17, -0.8164965809277259, nan, 0.0, 0.0], 'call': [<SignatureTranslatedFunction - Python:0xb7539dec / R:0xa686cec>, <IntVector - Python:0xb7534cac / R:0xa69e788>, <IntVector - Python:0xb7534d2c / R:0xa5f72f8>, <IntVector - Python:0xb7534c2c / R:0xa5f7320>, <IntVector - Python:0xb7534bac / R:0xa5f7348>], 'y': [1, 2, 3], 'x': [1, 2, 3], 'z': [1, 30, 3], 'wz': [0.0, 0.0, 0.0]}

我对rpy2(2.1.9)的旧版本进行了测试,对于更新的版本,可能有更方便的方法。