Matlab预分配

Question

我正在MATLAB中运行扩散反应方程的模拟，我事先为所有向量预先分配了内存，但是，在循环期间，我使用BICG解决了一个方程组， MATLAB使用的内存量正在增加。

例如：

concentration = zeros(N, iterations);

for t = 1:iterations
   concentration(:,t+1) = bicg(matrix, concentration(:,t));
end

随着程序的运行，MATLAB使用的内存量增加，这似乎表明矩阵，浓度随着程序的继续而增加，即使我预先分配了空间。这是因为矩阵中的元素变成了双精度而不是零吗？是否有更好的方法为此矩阵预分配内存，以便程序所需的所有内存将在开始时预先分配？这样对我来说会更容易，因为那时我会从一开始就知道程序需要多少内存，以及模拟是否会使计算机崩溃。

感谢您的帮助，伙计们。我做了一些搜索并没有找到答案，所以我希望我不会重复一个问题。

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编辑：

感谢Amro和stardt帮助你们。我尝试在MATLAB中运行'memory'，但是解释器说我的系统类型不支持命令。我重新运行模拟，但每10次迭代显示'whos concentration'，矩阵的分配大小不随时间变化。但是，我注意到矩阵的大小约为1.5 GB。尽管如此，系统监视器只显示MATLAB使用300 MB（但在模拟结束时它稳定增加到1 GB以上）。所以我猜测MATLAB预先分配了内存并且没有内存泄漏，但是系统监视器不计算内存，因为MATLAB开始在循环中向它写入值。我不知道为什么会这样，正如我想象的那样，写零会触发系统监视器将内存视为“正在使用”，但我猜这不是这种情况。

无论如何，感谢您对此的帮助。我会将你的两个答案都投票，因为我发现它们都有帮助，但我没有足够的声誉点来做到这一点。谢谢你们！

Answer 1

我真的怀疑这是一个内存泄漏，因为MATLAB中的大多数“对象”一旦超出范围就会自行清理。 AFAIK，MATLAB does not use a GC本身，但是管理记忆的确定性方法。

因此我怀疑问题更可能是由内存碎片造成的：当MATLAB为矩阵分配内存时，它必须是连续的。因此，当重复调用函数，创建和删除矩阵时，随着时间的推移，碎片成为一个明显的问题......

可能有助于您调试的一件事是使用未记录的profile on -memory，它将跟踪MATLAB探查器中的分配。查看monitoring tool by Joe Conti。此page也有一些有用的信息。

Answer 2

我假设您正在观看matlab的内存使用情况，例如Windows上的任务管理器。由于执行了bicg（）和在结束后没有被垃圾收集的变量，内存使用量可能会增加。分配给浓度矩阵的存储器保持不变。您可以输入

whos concentration

在“for”循环之前和之后查看为该变量分配了多少内存。