根据另一列的值按分位数过滤熊猫数据框

时间:2021-02-27 19:41:14

标签: python pandas dataframe

我在对数据集应用某些过滤器时遇到问题,不知道该怎么做。我有一个由 7 列组成的数据框。一列,participant_id 标识参与者(每个参与者唯一的数值),第二列指示每个参与者属于哪个组 (group),第三列称为 trial标识试验(每个参与者执行一项任务的多次试验)和四列var 1var 2var 3var 4(对应于记录的四个变量的数值)每次试验)。有参与者进行了 100 多次试验,参与者进行了大约 50 次试验。

简短示例:

       participant_id        group         trial       var1        var2       var3        var4        
         189                   A             1      -0.231046    0.245615  -0.581238   -0.593562  
         189                   A             2      -0.231046    0.245615  -0.581238   -0.593562
         189                   A             3      -0.231046    0.245615  -0.581238   -0.593562
         189                   A             4      -0.231046    0.245615  -0.581238   -0.593562
         345                   B             1         NaN       0.245615  -0.581238   -0.593562
         345                   B            378     -0.231046    0.245615  -0.581238   -0.593562
         227                   A             1      -0.231046    0.245615  -0.581238   -0.593562
         227                   A             1      -0.231046    0.245615  -0.581238   -0.593562
         227                   A             2      -0.231046    0.245615  -0.581238   -0.593562
         432                   B            517     -0.231046    0.245615     NaN      -0.593562
         432                   B             2      -0.231046    0.245615     NaN      -0.593562
         432                   B            333     -0.231046    0.245615  -0.581238   -0.593562

4 名参与者的示例。请注意,试用编号不是唯一的,因为两个不同的参与者可以有一个试用“1”,同一个参与者也可以有多个试用“1”。 (不要介意每行的 var 列的值都相同,在实际数据集中并非如此)。真实数据集是 10000 行。

我需要做的是根据每个唯一参与者的值保留前 n 个分位数试验 var1。我正在考虑使用 pandas .quantile(n) 函数,但我不知道如何告诉它应该单独分析每个参与者,而不是整行来获取分位数。

感谢任何帮助。

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

  • apply() 在一个组上传递每个组的 Dataframe
  • 提供了使用 lambda 以及独立函数的示例
  • 上述示例数据没有任何特征来证明其功能
df = pd.read_csv(io.StringIO("""       participant_id        group         trial       var1        var2       var3        var4        
         189                   A             1      -0.231046    0.245615  -0.581238   -0.593562  
         189                   A             2      -0.231046    0.245615  -0.581238   -0.593562
         189                   A             3      -0.231046    0.245615  -0.581238   -0.593562
         189                   A             4      -0.231046    0.245615  -0.581238   -0.593562
         345                   B             1         NaN       0.245615  -0.581238   -0.593562
         345                   B            378     -0.231046    0.245615  -0.581238   -0.593562
         227                   A             1      -0.231046    0.245615  -0.581238   -0.593562
         227                   A             1      -0.231046    0.245615  -0.581238   -0.593562
         227                   A             2      -0.231046    0.245615  -0.581238   -0.593562
         432                   B            517     -0.231046    0.245615     NaN      -0.593562
         432                   B             2      -0.231046    0.245615     NaN      -0.593562
         432                   B            333     -0.231046    0.245615  -0.581238   -0.593562
"""), sep="\s+")

def f(d):
    return d.quantile()

df.groupby("participant_id", as_index=False).apply(f)
df.groupby("participant_id", as_index=False).apply(lambda d: d.quantile())

更新

  • 问题是如何在组内利用 Pandas 分位数功能,由第一部分回答
  • 这特别说明了如何使用这种方法过滤到分位数内的行
  • 为了演示目的,生成了一个形状相同的随机数据集
# generate a useful dataset to analyse...
s = 100
df = pd.DataFrame({"participant_id":np.random.choice([189,227,345,432],s),
             "trial":np.random.randint(1,6,s),
             "group":np.random.choice(["A","B"],s),
              "var1":np.random.rand(s),
              "var2":np.random.rand(s),
              "var3":np.random.rand(s),
              "var4":np.random.rand(s),
             })

# split into 10 quantile bins and take 0th bin
# split into 10 quantile bins and take 0th bin
df.groupby("participant_id").apply(
    lambda d: d.loc[pd.qcut(d.var1, q=10, retbins=False, labels=False).le(0)]).droplevel(0)


<头>
participant_id 试用 var1 var2 var3 var4
13 189 3 A 0.0273875 0.87134 0.555792 0.67094
85 189 1 A 0.0106758 0.352578 0.481009 0.910989
91 189 4 A 0.00835706 0.644102 0.990459 0.816669
4 227 5 B 0.10132 0.870446 0.389972 0.313782
71 227 4 B 0.0221867 0.17566 0.659024 0.910838
74 227 1 A 0.0762526 0.458995 0.492384 0.556408
28 345 5 A 0.130674 0.0336628 0.0429884 0.799307
82 345 1 B 0.234522 0.371108 0.451911 0.54528
93 345 4 B 0.272915 0.594262 0.392285 0.56374
16 432 2 B 0.0403964 0.880132 0.45438 0.0466626
18 432 5 A 0.0884496 0.304541 0.969059 0.949315
22 432 2 B 0.115796 0.0371306 0.631284 0.537881
55 432 2 B 0.102859 0.0416843 0.761466 0.56438