numpy中的3D切片系列

时间:2011-07-08 06:56:46

标签: python image numpy matplotlib slice

我有一个3D数组,代表笛卡尔空间的密度值。要获得2D图像,我只需使用sum(array,2)对其中一个轴求和,然后使用matplotlib函数imshow(array2D)来获取2D图像。

我想要做的是使用imshow()一次只显示一个3D阵列切片,这样我就可以通过3D阵列“寻呼”以查看图像的不同点。

slice命令很简单:array[:,:,x]但我看不到至少一次显示每个切片的方法。除了每次手动更改程序文件之外,有没有人有其他建议?这可以以某种方式以交互方式完成吗?

1 个答案:

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我实际编写的代码完全符合我的想法,看看是否有帮助:

import numpy as np
import pylab

class plotter:
    def __init__(self, im, i=0):
        self.im = im
        self.i = i
        self.vmin = im.min()
        self.vmax = im.max()
        self.fig = pylab.figure()
        pylab.gray()
        self.ax = self.fig.add_subplot(111)
        self.draw()
        self.fig.canvas.mpl_connect('key_press_event',self)

    def draw(self):
        if self.im.ndim is 2:
            im = self.im
        if self.im.ndim is 3:
            im = self.im[...,self.i]
            self.ax.set_title('image {0}'.format(self.i))

        pylab.show()

        self.ax.imshow(im, vmin=self.vmin, vmax=self.vmax, interpolation=None)


    def __call__(self, event):
        old_i = self.i
        if event.key=='right':
            self.i = min(self.im.shape[2]-1, self.i+1)
        elif event.key == 'left':
            self.i = max(0, self.i-1)
        if old_i != self.i:
            self.draw()
            self.fig.canvas.draw()


def slice_show(im, i=0):
    plotter(im, i)

只需调用3d数组上的show函数,我就会告诉它要显示的切片。只要选择了绘图,就可以使用箭头键单步切片。

注意,这需要具有形状(x,y,z)的数组,例如,您可以使用np.dstack((im1,im2,...))从一系列2d数组中获取此类数组。

另请参阅Interactive matplotlib plot with two sliders以获取使用gui滑块执行此操作的代码示例