我有一个形状为:
的numpy数组(11L, 5L, 5L)
我想计算数组[0,:,],[1,:,]等等的每个'切片'的25个元素的平均值,返回11个值。
看起来很傻,但我无法弄清楚如何做到这一点。我认为mean(axis=x)
函数可以做到这一点,但我已经尝试了所有可能的轴组合,但没有一个给我我想要的结果。
我显然可以使用for循环和切片来做到这一点,但肯定有更好的方法吗?
答案 0 :(得分:15)
使用轴的元组:
>>> a = np.arange(11*5*5).reshape(11,5,5)
>>> a.mean(axis=(1,2))
array([ 12., 37., 62., 87., 112., 137., 162., 187., 212.,
237., 262.])
编辑:这仅适用于numpy版本1.7 +。
答案 1 :(得分:5)
您可以reshape(11, 25)
然后只调用mean
一次(更快):
a.reshape(11, 25).mean(axis=1)
或者,您可以拨打np.mean
两次(在我的计算机上慢约2倍):
a.mean(axis=2).mean(axis=1)
答案 2 :(得分:5)
始终可以使用np.einsum:
>>> a = np.arange(11*5*5).reshape(11,5,5)
>>> np.einsum('...ijk->...i',a)/(a.shape[-1]*a.shape[-2])
array([ 12, 37, 62, 87, 112, 137, 162, 187, 212, 237, 262])
适用于更高维数组(如果更改了轴标签,则所有这些方法都是如此):
>>> a = np.arange(10*11*5*5).reshape(10,11,5,5)
>>> (np.einsum('...ijk->...i',a)/(a.shape[-1]*a.shape[-2])).shape
(10, 11)
更快启动:
a = np.arange(11*5*5).reshape(11,5,5)
%timeit a.reshape(11, 25).mean(axis=1)
10000 loops, best of 3: 21.4 us per loop
%timeit a.mean(axis=(1,2))
10000 loops, best of 3: 19.4 us per loop
%timeit np.einsum('...ijk->...i',a)/(a.shape[-1]*a.shape[-2])
100000 loops, best of 3: 8.26 us per loop
随着数组大小的增加,比其他方法稍微好一些。
使用dtype=np.float64
并没有明显改变上述时间,所以只需要仔细检查:
a = np.arange(110*50*50,dtype=np.float64).reshape(110,50,50)
%timeit a.reshape(110,2500).mean(axis=1)
1000 loops, best of 3: 307 us per loop
%timeit a.mean(axis=(1,2))
1000 loops, best of 3: 308 us per loop
%timeit np.einsum('...ijk->...i',a)/(a.shape[-1]*a.shape[-2])
10000 loops, best of 3: 145 us per loop
还有一些有趣的事情:
%timeit np.sum(a) #37812362500.0
100000 loops, best of 3: 293 us per loop
%timeit np.einsum('ijk->',a) #37812362500.0
100000 loops, best of 3: 144 us per loop