我试图在 networkx 中描绘传输网络,到目前为止我一直做得很好,但问题如下: 我从一个txt文件中加载了一个edgelist,格式如下:
61 1
54 79
66 134
68 57
等等。另外,为了在正确的位置绘制网络节点,我加载并添加了一个带有节点坐标的 txt 文件,格式如下:
1 478947.434 4204495.502
2 478909.145 4204244.629
3 479065.936 4204709.003
4 478880.827 4204297.676
5 478993.409 4204167.957
之后,我运行以下脚本,我的网络被正确描绘,位置明智。
import networkx as nx
import numpy as py
import copy
import matplotlib.pyplot as plt
import xlwings as xw
from xlwings import Book, Range
pos={}
with open(r'C:\Users\alexl\Documents\new_python\nodes_coordinates.txt') as f:
for line in f:
node, x, y = line.split()
pos[node] = float(x), float(y)
print(pos)
network0 = nx.read_edgelist(r'C:\Users\alexl\Documents\new_python\init_edgelist.txt', create_using = nx.OrderedDiGraph)
nx.draw(network0, pos = pos, with_labels = True, edge_color = G, edge_cmap = plt.cm.Reds, connectionstyle = 'arc3,rad=0.1')
plt.show()
现在,我想要的是为每条边正确分配“权重”,并通过此属性为其着色。对于每条边,都有 3 种可能的结果,0、1 和 2,所以我想要 3 种不同的颜色,例如,红色代表 0,绿色代表 1,蓝色代表 2。我拥有的是这样的 Python 字典:
{0: 1.0, 1: 1.0, 2: 0.0, 3: 1.0, 4: 1.0, 5: 0.0, 6: 0.0, 7: 0.0, 8: 1.0,...
等。第一个值 (1.0) 对应于上面 edgelist 的第一条边,第二个 (1.0) 对应于第二条边,依此类推。但我看到 networkx 不理解这一点,并且没有正确地为我的网络着色。我将字典转换为列表并执行以下操作:
var1 = G.values()
list1 = list(var1)
col = []
for n in range(len(list1)):
if list1[n] == 0:
col.append('b')
elif list1[n] == 1:
#col.append('r')
else:
#col.append('g')
nx.draw(network0, pos = pos, with_labels = True, edge_color = col, edge_cmap = plt.cm.Reds, connectionstyle = 'arc3,rad=0.1')
我检查了结果,但对应的不是正确的。我认为,如果列表中有 32 个“0”,它会用我分配给它的颜色为 32 个边缘着色,但不是正确的颜色。 (但每次我运行它时,相同的 32 条边都是这样着色的,所以它可能不是随机的。)我想知道什么是不正确的。我也尝试将它作为字典(不转换为列表),但实际上颜色超过 3,我不知道为什么。 我是否应该尝试将这些值(0、1、1、2 等)添加到 edgelist.txt 以便正确完成分配?
答案 0 :(得分:1)
传递给绘图函数的边的顺序很重要。
您需要确保您的 edge_color
列表(col
) 与 network0.edges
的顺序相同,但事实并非如此。
发生这种情况是因为 network0.edges
与您可能假设的 init_edgelist.txt
文件的顺序不同。
要检查这一点,请尝试打印 network0.edges
并进行比较。
相反,我建议在创建 network0
时向边缘添加带有假装颜色的边缘权重,如下所示:
G = {0: 1.0, 1: 1.0, 2: 0.0, 3: 1.0, 4: 1.0, 5: 0.0, 6: 0.0, 7: 0.0, 8: 1.0}
list1 = list(G.values())
col = []
for n in range(len(list1)):
if list1[n] == 0:
col.append('b')
elif list1[n] == 1:
col.append('r')
else:
col.append('g')
network0 = nx.OrderedDiGraph()
i = 0
with open(r'init_edgelist.txt') as f:
for line in f:
n1, n2 = line.split()
network0.add_edge(n1, n2, color = col[i])
i += 1
然后你只需要提取颜色并绘制:
colors = [network0[u][v]['color'] for u,v in network0.edges()]
nx.draw(network0, pos = pos, with_labels = True, edge_color = colors, edge_cmap = plt.cm.Reds, connectionstyle='arc3,rad=0.1')
import networkx as nx
import numpy as py
import copy
import matplotlib.pyplot as plt
import xlwings as xw
from xlwings import Book, Range
pos={}
with open(r'nodes_coordinates.txt') as f:
for line in f:
node, x, y = line.split()
pos[node] = float(x), float(y)
#print(pos)
G = {0: 1.0, 1: 1.0, 2: 0.0, 3: 1.0, 4: 1.0, 5: 0.0, 6: 0.0, 7: 0.0, 8: 1.0}
list1 = list(G.values())
col=[]
for n in range(len(list1)):
if list1[n] == 0:
col.append('b')
elif list1[n] == 1:
col.append('r')
else:
col.append('g')
network0 = nx.OrderedDiGraph()
i = 0
with open(r'init_edgelist.txt') as f:
for line in f:
n1, n2 = line.split()
network0.add_edge(n1,n2, color=col[i])
i += 1
#print(network0.edges())
colors = [network0[u][v]['color'] for u,v in network0.edges()]
nx.draw(network0,pos=pos,with_labels=True,edge_color=colors,edge_cmap=plt.cm.Reds, connectionstyle='arc3,rad=0.1')