Question

首先，可能需要将其移至超级用户。我无法确定哪个场地更好。

我正在尝试编写一个将在启动/重启时运行的R脚本，并将该计算机添加到doRedis个工作池中。（doRedis是foreach后端）。

这是我的R脚本，“〜/ Rworker.R”

#Define Parameters
require(multicore)
Host <- 'ip_of_doRedis_Server'
cores <- multicore:::detectCores()
TO <- 24*3600

#Start Workers
require('doRedis')
startLocalWorkers(cores,'jobs',host=Host,port=6379, timeout = TO)

我可以使用命令从命令行运行此脚本 sudo R CMD BATCH ~/Rworker.R ~/RLog。

接下来，我编写了一个shell脚本来运行R脚本，标题为“/etc/init.d/StartWorkers.sh”

#!/bin/sh
sudo echo "Starting R workers"
sudo R CMD BATCH ~/Rworker.R ~/RLog

我使用chmod +x StartWorkers.sh使这个shell脚本可执行。当我运行./StartWorkers.sh时，一切运行良好，R会话启动，工作人员被添加到池中。

现在，我需要在启动/重启机器时运行这个shell脚本，所以我输入 update-rc.d StartWorkers.sh defaults。此命令似乎有效，但我收到以下警告： 'update-rc.d：警告：/etc/init.d/StartWorkers.sh缺少LSB信息'

但是，使用rcconf检查确认“StartWorkers.R”在启动列表中。

但是，当我重新启动计算机时，脚本无法运行。我究竟做错了什么？ shell脚本从命令行运行正常，但在我尝试在启动时运行它时失败。

/编辑：好的，根据Dirk的回答，我安装了更小的，并将'StartWorkers.sh'更改为以下内容：

#! /usr/bin/r

#Define Parameters
require(multicore)
Host <- 'zachec2.dyndns.org'
cores <- multicore:::detectCores()
TO <- 24*3600

#Start Workers
require('doRedis')
startLocalWorkers(cores,'jobs',host=Host,port=6379, timeout = TO)

但是当我运行它时，我得到以下输出：

Loading required package: utils
Loading required package: multicore
Warning message:
In library(package, lib.loc = lib.loc, character.only = TRUE, logical.return = TRUE,  :
  there is no package called 'multicore'
Error in loadNamespace(name) : there is no package called 'multicore'
Calls: ::: ... tryCatch -> tryCatchList -> tryCatchOne -> <Anonymous>
Execution halted

我知道我的系统上安装了多核！

/ EDIT2：我必须将所有R包都移到cd /usr/lib/R/site-library，现在更小的shell脚本可以工作了。我将脚本添加到/etc/rc.local，它启动完美！

Answer 1

这是一个R问题，有点在Ubuntu系统管理问题上。这里有几点：

对于简单的启动任务，我建议您只使用/etc/rc.local来附加工作。
我不喜欢R CMD BATCH这就是为什么Jeff Horner和我写littler给你/usr/bin/r和更简单的R脚本。 R本身也给你Rscript;任何一个都优于R CMD BATCH。
要测试脚本，只需以root身份运行它们。一旦他们将其添加到/etc/rc.local。

希望这会有所帮助。 r-sig-debian列表也是Ubuntu / Debian技巧的一个很好的来源。

在启动时运行R脚本

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